Characterization of Protein Complexes and Subcomplexes in Protein-Protein Interaction Databases
المؤلفون المشاركون
Zaki, Nazar
Mohamed, Elfadil A.
Mora, Antonio
المصدر
Biochemistry Research International
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-02-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The identification and characterization of protein complexes implicated in protein-protein interaction data are crucial to the understanding of the molecular events under normal and abnormal physiological conditions.
This paper provides a novel characterization of subcomplexes in protein interaction databases, stressing definition and representation issues, quantification, biological validation, network metrics, motifs, modularity, and gene ontology (GO) terms.
The paper introduces the concept of “nested group” as a way to represent subcomplexes and estimates that around 15% of those nested group with the higher Jaccard index may be a result of data artifacts in protein interaction databases, while a number of them can be found in biologically important modular structures or dynamic structures.
We also found that networkcentralities, enrichment in essential proteins, GO terms related to regulation, imperfect 5-cliquemotifs, and higher GO homogeneity can be used to identify proteins in nested complexes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zaki, Nazar& Mohamed, Elfadil A.& Mora, Antonio. 2015. Characterization of Protein Complexes and Subcomplexes in Protein-Protein Interaction Databases. Biochemistry Research International،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057607
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zaki, Nazar…[et al.]. Characterization of Protein Complexes and Subcomplexes in Protein-Protein Interaction Databases. Biochemistry Research International No. 2015 (2015), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057607
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zaki, Nazar& Mohamed, Elfadil A.& Mora, Antonio. Characterization of Protein Complexes and Subcomplexes in Protein-Protein Interaction Databases. Biochemistry Research International. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1057607
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1057607
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر