DNA-Encoded Chromatin Structural Intron Boundary Signals Identify Conserved Genes with Common Function
المؤلفون المشاركون
Fincher, Justin A.
Tyson, Gary S.
Dennis, Jonathan H.
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-03-11
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The regulation of metazoan gene expression occurs in part by pre-mRNA splicing into mature RNAs.
Signals affecting the efficiency and specificity with which introns are removed have not been completely elucidated.
Splicing likely occurs cotranscriptionally, with chromatin structure playing a key regulatory role.
We calculated DNA encoded nucleosome occupancy likelihood (NOL) scores at the boundaries between introns and exons across five metazoan species.
We found that (i) NOL scores reveal a sequence-based feature at the introns on both sides of the intron-exon boundary; (ii) this feature is not part of any recognizable consensus sequence; (iii) this feature is conserved throughout metazoa; (iv) this feature is enriched in genes sharing similar functions: ATPase activity, ATP binding, helicase activity, and motor activity; (v) genes with these functions exhibit different genomic characteristics; (vi) in vivo nucleosome positioning data confirm ontological enrichment at this feature; and (vii) genes with this feature exhibit unique dinucleotide distributions at the intron-exon boundary.
The NOL scores point toward a physical property of DNA that may play a role in the mechanism of pre-mRNA splicing.
These results provide a foundation for identification of a new set of regulatory DNA elements involved in splicing regulation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Fincher, Justin A.& Tyson, Gary S.& Dennis, Jonathan H.. 2015. DNA-Encoded Chromatin Structural Intron Boundary Signals Identify Conserved Genes with Common Function. International Journal of Genomics،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1065992
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Fincher, Justin A.…[et al.]. DNA-Encoded Chromatin Structural Intron Boundary Signals Identify Conserved Genes with Common Function. International Journal of Genomics No. 2015 (2015), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1065992
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Fincher, Justin A.& Tyson, Gary S.& Dennis, Jonathan H.. DNA-Encoded Chromatin Structural Intron Boundary Signals Identify Conserved Genes with Common Function. International Journal of Genomics. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1065992
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1065992
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر