![](/images/graphics-bg.png)
RECORD: Reference-Assisted Genome Assembly for Closely Related Genomes
المؤلفون المشاركون
Buza, Krisztian
Wilczynski, Bartek
Dojer, Norbert
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-10-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
Next-generation sequencing technologies are now producing multiple times the genome size in total reads from a single experiment.
This is enough information to reconstruct at least some of the differences between the individual genome studied in the experiment and the reference genome of the species.
However, in most typical protocols, this information is disregarded and the reference genome is used.
Results.
We provide a new approach that allows researchers to reconstruct genomes very closely related to the reference genome (e.g., mutants of the same species) directly from the reads used in the experiment.
Our approach applies de novo assembly software to experimental reads and so-called pseudoreads and uses the resulting contigs to generate a modified reference sequence.
In this way, it can very quickly, and at no additional sequencing cost, generate new, modified reference sequence that is closer to the actual sequenced genome and has a full coverage.
In this paper, we describe our approach and test its implementation called RECORD.
We evaluate RECORD on both simulated and real data.
We made our software publicly available on sourceforge.
Conclusion.
Our tests show that on closely related sequences RECORD outperforms more general assisted-assembly software.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Buza, Krisztian& Wilczynski, Bartek& Dojer, Norbert. 2015. RECORD: Reference-Assisted Genome Assembly for Closely Related Genomes. International Journal of Genomics،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1066027
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Buza, Krisztian…[et al.]. RECORD: Reference-Assisted Genome Assembly for Closely Related Genomes. International Journal of Genomics No. 2015 (2015), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1066027
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Buza, Krisztian& Wilczynski, Bartek& Dojer, Norbert. RECORD: Reference-Assisted Genome Assembly for Closely Related Genomes. International Journal of Genomics. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1066027
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1066027
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)