MIrExpress: A Database for Gene Coexpression Correlation in Immune Cells Based on Mutual Information and Pearson Correlation
المؤلفون المشاركون
Wang, Luman
Mo, Qiaochu
Wang, Jianxin
المصدر
Journal of Immunology Research
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-12-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Most current gene coexpression databases support the analysis for linear correlation of gene pairs, but not nonlinear correlation of them, which hinders precisely evaluating the gene-gene coexpression strengths.
Here, we report a new database, MIrExpress, which takes advantage of the information theory, as well as the Pearson linear correlation method, to measure the linear correlation, nonlinear correlation, and their hybrid of cell-specific gene coexpressions in immune cells.
For a given gene pair or probe set pair input by web users, both mutual information (MI) and Pearson correlation coefficient (r) are calculated, and several corresponding values are reported to reflect their coexpression correlation nature, including MI and r values, their respective rank orderings, their rank comparison, and their hybrid correlation value.
Furthermore, for a given gene, the top 10 most relevant genes to it are displayed with the MI, r, or their hybrid perspective, respectively.
Currently, the database totally includes 16 human cell groups, involving 20,283 human genes.
The expression data and the calculated correlation results from the database are interactively accessible on the web page and can be implemented for other related applications and researches.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Luman& Mo, Qiaochu& Wang, Jianxin. 2015. MIrExpress: A Database for Gene Coexpression Correlation in Immune Cells Based on Mutual Information and Pearson Correlation. Journal of Immunology Research،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1068367
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Luman…[et al.]. MIrExpress: A Database for Gene Coexpression Correlation in Immune Cells Based on Mutual Information and Pearson Correlation. Journal of Immunology Research No. 2015 (2015), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1068367
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Luman& Mo, Qiaochu& Wang, Jianxin. MIrExpress: A Database for Gene Coexpression Correlation in Immune Cells Based on Mutual Information and Pearson Correlation. Journal of Immunology Research. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1068367
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1068367
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر