Prediction of Protein-Protein Interaction By Metasample-Based Sparse Representation
المؤلفون المشاركون
Du, Xiuquan
Li, Xinrui
Zhang, Hanqian
Zhang, Yanping
المصدر
Mathematical Problems in Engineering
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-07-29
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Protein-protein interactions (PPIs) play key roles in many cellular processes such as transcription regulation, cell metabolism, and endocrine function.
Understanding these interactions takes a great promotion to the pathogenesis and treatment of various diseases.
A large amount of data has been generated by experimental techniques; however, most of these data are usually incomplete or noisy, and the current biological experimental techniques are always very time-consuming and expensive.
In this paper, we proposed a novel method (metasample-based sparse representation classification, MSRC) for PPIs prediction.
A group of metasamples are extracted from the original training samples and then use the l1-regularized least square method to express a new testing sample as the linear combination of these metasamples.
PPIs prediction is achieved by using a discrimination function defined in the representation coefficients.
The MSRC is applied to PPIs dataset; it achieves 84.9% sensitivity, and 94.55% specificity, which is slightly lower than support vector machine (SVM) and much higher than naive Bayes (NB), neural networks (NN), and k-nearest neighbor (KNN).
The result shows that the MSRC is efficient for PPIs prediction.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Du, Xiuquan& Li, Xinrui& Zhang, Hanqian& Zhang, Yanping. 2015. Prediction of Protein-Protein Interaction By Metasample-Based Sparse Representation. Mathematical Problems in Engineering،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1074910
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Du, Xiuquan…[et al.]. Prediction of Protein-Protein Interaction By Metasample-Based Sparse Representation. Mathematical Problems in Engineering No. 2015 (2015), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1074910
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Du, Xiuquan& Li, Xinrui& Zhang, Hanqian& Zhang, Yanping. Prediction of Protein-Protein Interaction By Metasample-Based Sparse Representation. Mathematical Problems in Engineering. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1074910
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1074910
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر