![](/images/graphics-bg.png)
freeQuant: A Mass Spectrometry Label-Free Quantification Software Tool for Complex Proteome Analysis
المؤلفون المشاركون
Pan, Chao
Li, Zhenye
Duan, Huilong
Deng, Ning
المصدر
العدد
المجلد 2015، العدد 2015 (31 ديسمبر/كانون الأول 2015)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2015-11-08
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Study of complex proteome brings forward higher request for the quantification method using mass spectrometry technology.
In this paper, we present a mass spectrometry label-free quantification tool for complex proteomes, called freeQuant, which integrated quantification with functional analysis effectively.
freeQuant consists of two well-integrated modules: label-free quantification and functional analysis with biomedical knowledge.
freeQuant supports label-free quantitative analysis which makes full use of tandem mass spectrometry (MS/MS) spectral count, protein sequence length, shared peptides, and ion intensity.
It adopts spectral count for quantitative analysis and builds a new method for shared peptides to accurately evaluate abundance of isoforms.
For proteins with low abundance, MS/MS total ion count coupled with spectral count is included to ensure accurate protein quantification.
Furthermore, freeQuant supports the large-scale functional annotations for complex proteomes.
Mitochondrial proteomes from the mouse heart, the mouse liver, and the human heart were used to evaluate the usability and performance of freeQuant.
The evaluation showed that the quantitative algorithms implemented in freeQuant can improve accuracy of quantification with better dynamic range.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Deng, Ning& Li, Zhenye& Pan, Chao& Duan, Huilong. 2015. freeQuant: A Mass Spectrometry Label-Free Quantification Software Tool for Complex Proteome Analysis. The Scientific World Journal،Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1078487
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Deng, Ning…[et al.]. freeQuant: A Mass Spectrometry Label-Free Quantification Software Tool for Complex Proteome Analysis. The Scientific World Journal No. 2015 (2015), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1078487
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Deng, Ning& Li, Zhenye& Pan, Chao& Duan, Huilong. freeQuant: A Mass Spectrometry Label-Free Quantification Software Tool for Complex Proteome Analysis. The Scientific World Journal. 2015. Vol. 2015, no. 2015, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1078487
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1078487
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)