Modeling Gene Regulation in Liver Hepatocellular Carcinoma with Random Forests
المؤلف
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-10-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Liver hepatocellular carcinoma (HCC) remains a leading cause of cancer-related death.
Poor understanding of the mechanisms underlying HCC prevents early detection and leads to high mortality.
We developed a random forest model that incorporates copy-number variation, DNA methylation, transcription factor, and microRNA binding information as features to predict gene expression in HCC.
Our model achieved a highly significant correlation between predicted and measured expression of held-out genes.
Furthermore, we identified potential regulators of gene expression in HCC.
Many of these regulators have been previously found to be associated with cancer and are differentially expressed in HCC.
We also evaluated our predicted target sets for these regulators by making comparison with experimental results.
Lastly, we found that the transcription factor E2F6, one of the candidate regulators inferred by our model, is predictive of survival rate in HCC.
Results of this study will provide directions for future prospective studies in HCC.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Kazan, Hilal. 2016. Modeling Gene Regulation in Liver Hepatocellular Carcinoma with Random Forests. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1096811
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Kazan, Hilal. Modeling Gene Regulation in Liver Hepatocellular Carcinoma with Random Forests. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1096811
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Kazan, Hilal. Modeling Gene Regulation in Liver Hepatocellular Carcinoma with Random Forests. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1096811
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1096811
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر