Using Small RNA Deep Sequencing Data to Detect Human Viruses
المؤلفون المشاركون
Gao, Shan
Ruan, Jishou
Wang, Fang
Sun, Yu
Chen, Rui
Chen, Xin
Chen, Chengjie
Kreuze, Jan F.
Fei, ZhangJun
Zhu, Xiao
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-03-15
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Small RNA sequencing (sRNA-seq) can be used to detect viruses in infected hosts without the necessity to have any prior knowledge or specialized sample preparation.
The sRNA-seq method was initially used for viral detection and identification in plants and then in invertebrates and fungi.
However, it is still controversial to use sRNA-seq in the detection of mammalian or human viruses.
In this study, we used 931 sRNA-seq runs of data from the NCBI SRA database to detect and identify viruses in human cells or tissues, particularly from some clinical samples.
Six viruses including HPV-18, HBV, HCV, HIV-1, SMRV, and EBV were detected from 36 runs of data.
Four viruses were consistent with the annotations from the previous studies.
HIV-1 was found in clinical samples without the HIV-positive reports, and SMRV was found in Diffuse Large B-Cell Lymphoma cells for the first time.
In conclusion, these results suggest the sRNA-seq can be used to detect viruses in mammals and humans.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Fang& Sun, Yu& Ruan, Jishou& Chen, Rui& Chen, Xin& Chen, Chengjie…[et al.]. 2016. Using Small RNA Deep Sequencing Data to Detect Human Viruses. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097115
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Fang…[et al.]. Using Small RNA Deep Sequencing Data to Detect Human Viruses. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097115
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Fang& Sun, Yu& Ruan, Jishou& Chen, Rui& Chen, Xin& Chen, Chengjie…[et al.]. Using Small RNA Deep Sequencing Data to Detect Human Viruses. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097115
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1097115
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر