![](/images/graphics-bg.png)
A Novel Peptide Binding Prediction Approach for HLA-DR Molecule Based on Sequence and Structural Information
المؤلفون المشاركون
Li, Zhao
Zhao, Yilei
Pan, Gaofeng
Tang, Jijun
Guo, Fei
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-05-31
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
MHC molecule plays a key role in immunology, and the molecule binding reaction with peptide is an important prerequisite for T cell immunity induced.
MHC II molecules do not have conserved residues, so they appear as open grooves.
As a consequence, this will increase the difficulty in predicting MHC II molecules binding peptides.
In this paper, we aim to propose a novel prediction method for MHC II molecules binding peptides.
First, we calculate sequence similarity and structural similarity between different MHC II molecules.
Then, we reorder pseudosequences according to descending similarity values and use a weight calculation formula to calculate new pocket profiles.
Finally, we use three scoring functions to predict binding cores and evaluate the accuracy of prediction to judge performance of each scoring function.
In the experiment, we set a parameter α in the weight formula.
By changing α value, we can observe different performances of each scoring function.
We compare our method with the best function to some popular prediction methods and ultimately find that our method outperforms them in identifying binding cores of HLA-DR molecules.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, Zhao& Zhao, Yilei& Pan, Gaofeng& Tang, Jijun& Guo, Fei. 2016. A Novel Peptide Binding Prediction Approach for HLA-DR Molecule Based on Sequence and Structural Information. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097476
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, Zhao…[et al.]. A Novel Peptide Binding Prediction Approach for HLA-DR Molecule Based on Sequence and Structural Information. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097476
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, Zhao& Zhao, Yilei& Pan, Gaofeng& Tang, Jijun& Guo, Fei. A Novel Peptide Binding Prediction Approach for HLA-DR Molecule Based on Sequence and Structural Information. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097476
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1097476
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)