![](/images/graphics-bg.png)
Parallel-SymD: A Parallel Approach to Detect Internal Symmetry in Protein Domains
المؤلفون المشاركون
KC, Dukka B.
Jha, Ashwani
Flurchick, K. M.
Bikdash, Marwan
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-09-26
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Internally symmetric proteins are proteins that have a symmetrical structure in their monomeric single-chain form.
Around 10–15% of the protein domains can be regarded as having some sort of internal symmetry.
In this regard, we previously published SymD (symmetry detection), an algorithm that determines whether a given protein structure has internal symmetry by attempting to align the protein to its own copy after the copy is circularly permuted by all possible numbers of residues.
SymD has proven to be a useful algorithm to detect symmetry.
In this paper, we present a new parallelized algorithm called Parallel-SymD for detecting symmetry of proteins on clusters of computers.
The achieved speedup of the new Parallel-SymD algorithm scales well with the number of computing processors.
Scaling is better for proteins with a larger number of residues.
For a protein of 509 residues, a speedup of 63 was achieved on a parallel system with 100 processors.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Jha, Ashwani& Flurchick, K. M.& Bikdash, Marwan& KC, Dukka B.. 2016. Parallel-SymD: A Parallel Approach to Detect Internal Symmetry in Protein Domains. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097830
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Jha, Ashwani…[et al.]. Parallel-SymD: A Parallel Approach to Detect Internal Symmetry in Protein Domains. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097830
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Jha, Ashwani& Flurchick, K. M.& Bikdash, Marwan& KC, Dukka B.. Parallel-SymD: A Parallel Approach to Detect Internal Symmetry in Protein Domains. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097830
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1097830
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)