![](/images/graphics-bg.png)
PairMotifChIP: A Fast Algorithm for Discovery of Patterns Conserved in Large ChIP-seq Data Sets
المؤلفون المشاركون
Huo, Hongwei
Yu, Qiang
Feng, Dazheng
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-10-24
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Identifying conserved patterns in DNA sequences, namely, motif discovery, is an important and challenging computational task.
With hundreds or more sequences contained, the high-throughput sequencing data set is helpful to improve the identification accuracy of motif discovery but requires an even higher computing performance.
To efficiently identify motifs in large DNA data sets, a new algorithm called PairMotifChIP is proposed by extracting and combining pairs of l-mers in the input with relatively small Hamming distance.
In particular, a method for rapidly extracting pairs of l-mers is designed, which can be used not only for PairMotifChIP, but also for other DNA data mining tasks with the same demand.
Experimental results on the simulated data show that the proposed algorithm can find motifs successfully and runs faster than the state-of-the-art motif discovery algorithms.
Furthermore, the validity of the proposed algorithm has been verified on real data.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Yu, Qiang& Huo, Hongwei& Feng, Dazheng. 2016. PairMotifChIP: A Fast Algorithm for Discovery of Patterns Conserved in Large ChIP-seq Data Sets. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097971
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Yu, Qiang…[et al.]. PairMotifChIP: A Fast Algorithm for Discovery of Patterns Conserved in Large ChIP-seq Data Sets. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097971
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Yu, Qiang& Huo, Hongwei& Feng, Dazheng. PairMotifChIP: A Fast Algorithm for Discovery of Patterns Conserved in Large ChIP-seq Data Sets. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1097971
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1097971
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)