18S Ribosomal RNA Evaluation as Preanalytical Quality Control for Animal DNA
المؤلفون المشاركون
Leonard, Cory Ann
Meli, Marina L.
Novacco, Marilisa
Borel, Nicole
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-09-08
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The 18S ribosomal RNA (rRNA) gene is present in all eukaryotic cells.
In this study, we evaluated the use of this gene to verify the presence of PCR-amplifiable host (animal) DNA as an indicator of sufficient sample quality for quantitative real-time PCR (qPCR) analysis.
We compared (i) samples from various animal species, tissues, and sample types, including swabs; (ii) multiple DNA extraction methods; and (iii) both fresh and formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples.
Results showed that 18S ribosomal RNA gene amplification was possible from all tissue samples evaluated, including avian, reptile, and FFPE samples and most swab samples.
A single swine rectal swab, which showed sufficient DNA quantity and the demonstrated lack of PCR inhibitors, nonetheless was negative by 18S qPCR.
Such a sample specifically illustrates the improvement of determination of sample integrity afforded by inclusion of 18S rRNA gene qPCR analysis in addition to spectrophotometric analysis and the use of internal controls for PCR inhibition.
Other possible applications for the described 18S rRNA qPCR are preselection of optimal tissue specimens for studies or preliminary screening of archived samples prior to acceptance for biobanking projects.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Leonard, Cory Ann& Meli, Marina L.& Novacco, Marilisa& Borel, Nicole. 2016. 18S Ribosomal RNA Evaluation as Preanalytical Quality Control for Animal DNA. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098393
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Leonard, Cory Ann…[et al.]. 18S Ribosomal RNA Evaluation as Preanalytical Quality Control for Animal DNA. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098393
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Leonard, Cory Ann& Meli, Marina L.& Novacco, Marilisa& Borel, Nicole. 18S Ribosomal RNA Evaluation as Preanalytical Quality Control for Animal DNA. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098393
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1098393
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر