ProFold: Protein Fold Classification with Additional Structural Features and a Novel Ensemble Classifier
المؤلفون المشاركون
Chen, Daozheng
Tian, Xiaoyu
Zhou, Bo
Gao, Jun
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-08-28
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Protein fold classification plays an important role in both protein functional analysis and drug design.
The number of proteins in PDB is very large, but only a very small part is categorized and stored in the SCOPe database.
Therefore, it is necessary to develop an efficient method for protein fold classification.
In recent years, a variety of classification methods have been used in many protein fold classification studies.
In this study, we propose a novel classification method called proFold.
We import protein tertiary structure in the period of feature extraction and employ a novel ensemble strategy in the period of classifier training.
Compared with existing similar ensemble classifiers using the same widely used dataset (DD-dataset), proFold achieves 76.2% overall accuracy.
Another two commonly used datasets, EDD-dataset and TG-dataset, are also tested, of which the accuracies are 93.2% and 94.3%, higher than the existing methods.
ProFold is available to the public as a web-server.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Chen, Daozheng& Tian, Xiaoyu& Zhou, Bo& Gao, Jun. 2016. ProFold: Protein Fold Classification with Additional Structural Features and a Novel Ensemble Classifier. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098563
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Chen, Daozheng…[et al.]. ProFold: Protein Fold Classification with Additional Structural Features and a Novel Ensemble Classifier. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098563
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Chen, Daozheng& Tian, Xiaoyu& Zhou, Bo& Gao, Jun. ProFold: Protein Fold Classification with Additional Structural Features and a Novel Ensemble Classifier. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098563
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1098563
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر