![](/images/graphics-bg.png)
Genomic Analysis of a Marine Bacterium: Bioinformatics for Comparison, Evaluation, and Interpretation of DNA Sequences
المؤلفون المشاركون
Rekadwad, Bhagwan N.
Khobragade, Chandrahasya N.
Gonzalez, Juan M.
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-11-01
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
A total of five highly related strains of an unidentified marine bacterium were analyzed through their short genome sequences (AM260709–AM260713).
Genome-to-Genome Distance (GGDC) showed high similarity to Pseudoalteromonas haloplanktis (X67024).
The generated unique Quick Response (QR) codes indicated no identity to other microbial species or gene sequences.
Chaos Game Representation (CGR) showed the number of bases concentrated in the area.
Guanine residues were highest in number followed by cytosine.
Frequency of Chaos Game Representation (FCGR) indicated that CC and GG blocks have higher frequency in the sequence from the evaluated marine bacterium strains.
Maximum GC content for the marine bacterium strains ranged 53-54%.
The use of QR codes, CGR, FCGR, and GC dataset helped in identifying and interpreting short genome sequences from specific isolates.
A phylogenetic tree was constructed with the bootstrap test (1000 replicates) using MEGA6 software.
Principal Component Analysis (PCA) was carried out using EMBL-EBI MUSCLE program.
Thus, generated genomic data are of great assistance for hierarchical classification in Bacterial Systematics which combined with phenotypic features represents a basic procedure for a polyphasic approach on unambiguous bacterial isolate taxonomic classification.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Rekadwad, Bhagwan N.& Gonzalez, Juan M.& Khobragade, Chandrahasya N.. 2016. Genomic Analysis of a Marine Bacterium: Bioinformatics for Comparison, Evaluation, and Interpretation of DNA Sequences. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098743
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Rekadwad, Bhagwan N.…[et al.]. Genomic Analysis of a Marine Bacterium: Bioinformatics for Comparison, Evaluation, and Interpretation of DNA Sequences. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098743
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Rekadwad, Bhagwan N.& Gonzalez, Juan M.& Khobragade, Chandrahasya N.. Genomic Analysis of a Marine Bacterium: Bioinformatics for Comparison, Evaluation, and Interpretation of DNA Sequences. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098743
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1098743
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)