![](/images/graphics-bg.png)
VGSC: A Web-Based Vector Graph Toolkit of Genome Synteny and Collinearity
المؤلفون المشاركون
Yin, T.
Dai, Xiaogang
Xu, Yiqing
Bi, Changwei
Wu, Guoxin
Wei, Suyun
Ye, Ning
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-02-24
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
In order to understand the colocalization of genetic loci amongst species, synteny and collinearity analysis is a frequent task in comparative genomics research.
However many analysis software packages are not effective in visualizing results.
Problems include lack of graphic visualization, simple representation, or inextensible format of outputs.
Moreover, higher throughput sequencing technology requires higher resolution image output.
Implementation.
To fill this gap, this paper publishes VGSC, the Vector Graph toolkit of genome Synteny and Collinearity, and its online service, to visualize the synteny and collinearity in the common graphical format, including both raster (JPEG, Bitmap, and PNG) and vector graphic (SVG, EPS, and PDF).
Result.
Users can upload sequence alignments from blast and collinearity relationship from the synteny analysis tools.
The website can generate the vector or raster graphical results automatically.
We also provide a java-based bytecode binary to enable the command-line execution.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Xu, Yiqing& Bi, Changwei& Wu, Guoxin& Wei, Suyun& Dai, Xiaogang& Yin, T.…[et al.]. 2016. VGSC: A Web-Based Vector Graph Toolkit of Genome Synteny and Collinearity. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098855
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Xu, Yiqing…[et al.]. VGSC: A Web-Based Vector Graph Toolkit of Genome Synteny and Collinearity. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098855
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Xu, Yiqing& Bi, Changwei& Wu, Guoxin& Wei, Suyun& Dai, Xiaogang& Yin, T.…[et al.]. VGSC: A Web-Based Vector Graph Toolkit of Genome Synteny and Collinearity. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1098855
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1098855
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)