Recombination HotspotColdspot Identification Combining Three Different Pseudocomponents via an Ensemble Learning Approach
المؤلفون المشاركون
Liu, Bingquan
Huang, Dong
Liu, Yumeng
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-7، 7ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-08-25
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
7
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Recombination presents a nonuniform distribution across the genome.
Genomic regions that present relatively higher frequencies of recombination are called hotspots while those with relatively lower frequencies of recombination are recombination coldspots.
Therefore, the identification of hotspots/coldspots could provide useful information for the study of the mechanism of recombination.
In this study, a new computational predictor called SVM-EL was proposed to identify hotspots/coldspots across the yeast genome.
It combined Support Vector Machines (SVMs) and Ensemble Learning (EL) based on three features including basic kmer (Kmer), dinucleotide-based auto-cross covariance (DACC), and pseudo dinucleotide composition (PseDNC).
These features are able to incorporate the nucleic acid composition and their order information into the predictor.
The proposed SVM-EL achieves an accuracy of 82.89% on a widely used benchmark dataset, which outperforms some related methods.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Liu, Bingquan& Liu, Yumeng& Huang, Dong. 2016. Recombination HotspotColdspot Identification Combining Three Different Pseudocomponents via an Ensemble Learning Approach. BioMed Research International،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1099080
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Liu, Bingquan…[et al.]. Recombination HotspotColdspot Identification Combining Three Different Pseudocomponents via an Ensemble Learning Approach. BioMed Research International No. 2016 (2016), pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1099080
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Liu, Bingquan& Liu, Yumeng& Huang, Dong. Recombination HotspotColdspot Identification Combining Three Different Pseudocomponents via an Ensemble Learning Approach. BioMed Research International. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-7.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1099080
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1099080
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر