A Run-Length Encoding Approach for Path Analysis of C. elegans Search Behavior
المؤلفون المشاركون
Huang, Li
Kim, Hongkyun
Furst, Jacob
Raicu, Daniela
المصدر
Computational and Mathematical Methods in Medicine
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-06-30
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The nematode Caenorhabditis elegans explores the environment using a combination of different movement patterns, which include straight movement, reversal, and turns.
We propose to quantify C.
elegans movement behavior using a computer vision approach based on run-length encoding of step-length data.
In this approach, the path of C.
elegans is encoded as a string of characters, where each character represents a path segment of a specific type of movement.
With these encoded string data, we perform k -means cluster analysis to distinguish movement behaviors resulting from different genotypes and food availability.
We found that shallow and sharp turns are the most critical factors in distinguishing the differences among the movement behaviors.
To validate our approach, we examined the movement behavior of tph-1 mutants that lack an enzyme responsible for serotonin biosynthesis.
A k -means cluster analysis with the path string-encoded data showed that tph-1 movement behavior on food is similar to that of wild-type animals off food.
We suggest that this run-length encoding approach is applicable to trajectory data in animal or human mobility data.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Huang, Li& Kim, Hongkyun& Furst, Jacob& Raicu, Daniela. 2016. A Run-Length Encoding Approach for Path Analysis of C. elegans Search Behavior. Computational and Mathematical Methods in Medicine،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1100113
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Huang, Li…[et al.]. A Run-Length Encoding Approach for Path Analysis of C. elegans Search Behavior. Computational and Mathematical Methods in Medicine No. 2016 (2016), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1100113
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Huang, Li& Kim, Hongkyun& Furst, Jacob& Raicu, Daniela. A Run-Length Encoding Approach for Path Analysis of C. elegans Search Behavior. Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1100113
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1100113
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر