![](/images/graphics-bg.png)
Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds
المؤلفون المشاركون
Iacolina, Laura
Stronen, Astrid V.
Pertoldi, Cino
Tokarska, Małgorzata
Nørgaard, Louise S.
Muñoz, Joaquin
Kjærsgaard, Anders
Ruiz-Gonzalez, Aritz
Kamiński, Stanisław
Purfield, Deirdre C.
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-10-30
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Runs of homozygosity (ROH), uninterrupted stretches of homozygous genotypes resulting from parents transmitting identical haplotypes to their offspring, have emerged as informative genome-wide estimates of autozygosity (inbreeding).
We used genomic profiles based on 698 K single nucleotide polymorphisms (SNPs) from nine breeds of domestic cattle (Bos taurus) and the European bison (Bison bonasus) to investigate how ROH distributions can be compared within and among species.
We focused on two length classes: 0.5–15 Mb to investigate ancient events and >15 Mb to address recent events (approximately three generations).
For each length class, we chose a few chromosomes with a high number of ROH, calculated the percentage of times a SNP appeared in a ROH, and plotted the results.
We selected areas with distinct patterns including regions where (1) all groups revealed an increase or decrease of ROH, (2) bison differed from cattle, (3) one cattle breed or groups of breeds differed (e.g., dairy versus meat cattle).
Examination of these regions in the cattle genome showed genes potentially important for natural and human-induced selection, concerning, for example, meat and milk quality, metabolism, growth, and immune function.
The comparative methodology presented here permits visual identification of regions of interest for selection, breeding programs, and conservation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Iacolina, Laura& Stronen, Astrid V.& Pertoldi, Cino& Tokarska, Małgorzata& Nørgaard, Louise S.& Muñoz, Joaquin…[et al.]. 2016. Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds. International Journal of Genomics،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106143
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Iacolina, Laura…[et al.]. Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds. International Journal of Genomics No. 2016 (2016), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106143
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Iacolina, Laura& Stronen, Astrid V.& Pertoldi, Cino& Tokarska, Małgorzata& Nørgaard, Louise S.& Muñoz, Joaquin…[et al.]. Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds. International Journal of Genomics. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106143
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1106143
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)