Transcriptome Sequencing of Gynostemma pentaphyllum to Identify Genes and Enzymes Involved in Triterpenoid Biosynthesis
المؤلفون المشاركون
Chen, Qicong
Ma, Chengtong
Qian, Jieying
Lan, Xiuwan
Chao, Naixia
Sun, Jian
Wu, Yaosheng
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-12-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
G.
pentaphyllum (Gynostemma pentaphyllum), a creeping herbaceous perennial with many important medicinal properties, is widely distributed in Asia.
Gypenosides (triterpenoid saponins), the main effective components of G.
pentaphyllum, are well studied.
FPS (farnesyl pyrophosphate synthase), SS (squalene synthase), and SE (squalene epoxidase) are the main enzymes involved in the synthesis of triterpenoid saponins.
Considering the important medicinal functions of G.
pentaphyllum, it is necessary to investigate the transcriptomic information of G.
pentaphyllum to facilitate future studies of transcriptional regulation.
After sequencing G.
pentaphyllum, we obtained 50,654,708 unigenes.
Next, we used RPKM (reads per kilobases per million reads) to calculate expression of the unigenes and we performed comparison of our data to that contained in five common databases to annotate different aspects of the unigenes.
Finally, we noticed that FPS, SS, and SE showed differential expression of enzymes in DESeq.
Leaves showed the highest expression of FPS, SS, and SE relative to the other two tissues.
Our research provides transcriptomic information of G.
pentaphyllum in its natural environment and we found consistency in unigene expression, enzymes expression (FPS, SS, and SE), and the distribution of gypenosides content in G.
pentaphyllum.
Our results will enable future related studies of G.
pentaphyllum.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Chen, Qicong& Ma, Chengtong& Qian, Jieying& Lan, Xiuwan& Chao, Naixia& Sun, Jian…[et al.]. 2016. Transcriptome Sequencing of Gynostemma pentaphyllum to Identify Genes and Enzymes Involved in Triterpenoid Biosynthesis. International Journal of Genomics،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106185
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Chen, Qicong…[et al.]. Transcriptome Sequencing of Gynostemma pentaphyllum to Identify Genes and Enzymes Involved in Triterpenoid Biosynthesis. International Journal of Genomics No. 2016 (2016), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106185
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Chen, Qicong& Ma, Chengtong& Qian, Jieying& Lan, Xiuwan& Chao, Naixia& Sun, Jian…[et al.]. Transcriptome Sequencing of Gynostemma pentaphyllum to Identify Genes and Enzymes Involved in Triterpenoid Biosynthesis. International Journal of Genomics. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1106185
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1106185
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر