![](/images/graphics-bg.png)
Evaluation of Plaid Models in Biclustering of Gene Expression Data
المؤلفون المشاركون
Baghestani, Ahmad Rida
Alavi Majd, Hamid
Shahsavari, Soodeh
Tabatabaei, Seyyed Mohammad
Khadem Bashi, Naghme
Hamidpour, Mohsen
Rezaei-Tavirani, Mostafa
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-03-09
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
Biclustering algorithms for the analysis of high-dimensional gene expression data were proposed.
Among them, the plaid model is arguably one of the most flexible biclustering models up to now.
Objective.
The main goal of this study is to provide an evaluation of plaid models.
To that end, we will investigate this model on both simulation data and real gene expression datasets.
Methods.
Two simulated matrices with different degrees of overlap and noise are generated and then the intrinsic structure of these data is compared with biclusters result.
Also, we have searched biologically significant discovered biclusters by GO analysis.
Results.
When there is no noise the algorithm almost discovered all of the biclusters but when there is moderate noise in the dataset, this algorithm cannot perform very well in finding overlapping biclusters and if noise is big, the result of biclustering is not reliable.
Conclusion.
The plaid model needs to be modified because when there is a moderate or big noise in the data, it cannot find good biclusters.
This is a statistical model and is a quite flexible one.
In summary, in order to reduce the errors, model can be manipulated and distribution of error can be changed.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Alavi Majd, Hamid& Shahsavari, Soodeh& Baghestani, Ahmad Rida& Tabatabaei, Seyyed Mohammad& Khadem Bashi, Naghme& Rezaei-Tavirani, Mostafa…[et al.]. 2016. Evaluation of Plaid Models in Biclustering of Gene Expression Data. Scientifica،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1117604
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Alavi Majd, Hamid…[et al.]. Evaluation of Plaid Models in Biclustering of Gene Expression Data. Scientifica No. 2016 (2016), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1117604
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Alavi Majd, Hamid& Shahsavari, Soodeh& Baghestani, Ahmad Rida& Tabatabaei, Seyyed Mohammad& Khadem Bashi, Naghme& Rezaei-Tavirani, Mostafa…[et al.]. Evaluation of Plaid Models in Biclustering of Gene Expression Data. Scientifica. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1117604
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1117604
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)