System Review about Function Role of ESCC Driver Gene KDM6A by Network Biology Approach
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2016، العدد 2016 (31 ديسمبر/كانون الأول 2016)، ص ص. 1-6، 6ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2016-05-17
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الطب البشري
تكنولوجيا المعلومات وعلم الحاسوب
الملخص EN
Background.
KDM6A (Lysine (K)-Specific Demethylase 6A) is the driver gene related to esophageal squamous cell carcinoma (ESCC).
In order to provide more biological insights into KDM6A, in this paper, we treat PPI (protein-protein interaction) network derived from KDM6A as a conceptual framework and follow it to review its biological function.
Method.
We constructed a PPI network with Cytoscape software and performed clustering of network with Clust&See.
Then, we evaluate the pathways, which are statistically involved in the network derived from KDM6A.
Lastly, gene ontology analysis of clusters of genes in the network was conducted.
Result.
The network includes three clusters that consist of 74 nodes connected via 453 edges.
Fifty-five pathways are statistically involved in the network and most of them are functionally related to the processes of cell cycle, gene expression, and carcinogenesis.
The biology themes of clusters 1, 2, and 3 are chromatin modification, regulation of gene expression by transcription factor complex, and control of cell cycle, respectively.
Conclusion.
The PPI network presents a panoramic view which can facilitate for us to understand the function role of KDM6A.
It is a helpful way by network approach to perform system review on a certain gene.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ran, Jihua& Li, Hui& Li, Huiwu. 2016. System Review about Function Role of ESCC Driver Gene KDM6A by Network Biology Approach. The Scientific World Journal،Vol. 2016, no. 2016, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1120330
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ran, Jihua…[et al.]. System Review about Function Role of ESCC Driver Gene KDM6A by Network Biology Approach. The Scientific World Journal No. 2016 (2016), pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1120330
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ran, Jihua& Li, Hui& Li, Huiwu. System Review about Function Role of ESCC Driver Gene KDM6A by Network Biology Approach. The Scientific World Journal. 2016. Vol. 2016, no. 2016, pp.1-6.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1120330
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1120330
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر