Mining TCGA Database for Tumor Microenvironment-Related Genes of Prognostic Value in Hepatocellular Carcinoma
المؤلفون المشاركون
Deng, Zhenfeng
Wang, Jilong
Xu, Banghao
Jin, Zongrui
Wu, Guolin
Zeng, Jingjing
Peng, Minhao
Guo, Ya
Wen, Zhang
المصدر
العدد
المجلد 2019، العدد 2019 (31 ديسمبر/كانون الأول 2019)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2019-11-19
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common and lethal malignancies.
Recent studies reveal that tumor microenvironment (TME) components significantly affect HCC growth and progression, particularly the infiltrating stromal and immune cells.
Thus, mining of TME-related biomarkers is crucial to improve the survival of patients with HCC.
Public access of The Cancer Genome Atlas (TCGA) database allows convenient performance of gene expression-based analysis of big data, which contributes to the exploration of potential association between genes and prognosis of a variety of malignancies, including HCC.
The “Estimation of STromal and Immune cells in MAlignant Tumors using Expression data” algorithm renders the quantification of the stromal and immune components in TME possible by calculating the stromal and immune scores.
Differentially expressed genes (DEGs) were screened by dividing the HCC cohort of TCGA database into high- and low-score groups according to stromal and immune scores.
Further analyses of functional enrichment and protein-protein interaction networks show that the DEGs are mainly involved in immune response, cell adhesion, and extracellular matrix.
Finally, seven DEGs have significant association with HCC poor outcomes.
These genes contain FABP3, GALNT5, GPR84, ITGB6, MYEOV, PLEKHS1, and STRA6 and may be candidate biomarkers for HCC prognosis.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Deng, Zhenfeng& Wang, Jilong& Xu, Banghao& Jin, Zongrui& Wu, Guolin& Zeng, Jingjing…[et al.]. 2019. Mining TCGA Database for Tumor Microenvironment-Related Genes of Prognostic Value in Hepatocellular Carcinoma. BioMed Research International،Vol. 2019, no. 2019, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1123810
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Deng, Zhenfeng…[et al.]. Mining TCGA Database for Tumor Microenvironment-Related Genes of Prognostic Value in Hepatocellular Carcinoma. BioMed Research International No. 2019 (2019), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1123810
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Deng, Zhenfeng& Wang, Jilong& Xu, Banghao& Jin, Zongrui& Wu, Guolin& Zeng, Jingjing…[et al.]. Mining TCGA Database for Tumor Microenvironment-Related Genes of Prognostic Value in Hepatocellular Carcinoma. BioMed Research International. 2019. Vol. 2019, no. 2019, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1123810
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1123810
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر