Circular RNA Profiling by Illumina Sequencing via Template-Dependent Multiple Displacement Amplification
المؤلفون المشاركون
Guria, Ashirbad
Velayudha Vimala Kumar, Kavitha
Srikakulam, Nagesh
Krishnamma, Anakha
Chanda, Saibal
Sharma, Satyam
Fan, Xiaofeng
Pandi, Gopal
المصدر
العدد
المجلد 2019، العدد 2019 (31 ديسمبر/كانون الأول 2019)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2019-01-28
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Circular RNAs (circRNAs) are newly discovered incipient non-coding RNAs with potential roles in disease progression in living organisms.
Significant reports, since their inception, highlight the abundance and putative functional roles of circRNAs in every organism checked for, like O.
sativa, Arabidopsis, human, and mouse.
CircRNA expression is generally less than their linear mRNA counterparts which fairly explains the competitive edge of canonical splicing over non-canonical splicing.
However, existing methods may not be sensitive enough for the discovery of low-level expressed circRNAs.
By combining template-dependent multiple displacement amplification (tdMDA), Illumina sequencing, and bioinformatics tools, we have developed an experimental protocol that is able to detect 1,875 novel and known circRNAs from O.
sativa.
The same method also revealed 9,242 putative circRNAs in less than 40 million reads for the first time from the Nicotiana benthamiana whose genome has not been fully annotated.
Supported by the PCR-based validation and Sanger sequencing of selective circRNAs, our method represents a valuable tool in profiling circRNAs from the organisms with or without genome annotation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Guria, Ashirbad& Velayudha Vimala Kumar, Kavitha& Srikakulam, Nagesh& Krishnamma, Anakha& Chanda, Saibal& Sharma, Satyam…[et al.]. 2019. Circular RNA Profiling by Illumina Sequencing via Template-Dependent Multiple Displacement Amplification. BioMed Research International،Vol. 2019, no. 2019, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124074
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Guria, Ashirbad…[et al.]. Circular RNA Profiling by Illumina Sequencing via Template-Dependent Multiple Displacement Amplification. BioMed Research International No. 2019 (2019), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124074
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Guria, Ashirbad& Velayudha Vimala Kumar, Kavitha& Srikakulam, Nagesh& Krishnamma, Anakha& Chanda, Saibal& Sharma, Satyam…[et al.]. Circular RNA Profiling by Illumina Sequencing via Template-Dependent Multiple Displacement Amplification. BioMed Research International. 2019. Vol. 2019, no. 2019, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124074
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1124074
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر