![](/images/graphics-bg.png)
N-Linked Glycopeptide Identification Based on Open Mass Spectral Library Search
المؤلفون المشاركون
Yang, Fuquan
An, Zhiwu
Shu, Qingbo
Lv, Hao
Shu, Lian
Wang, Jifeng
Fu, Yan
المصدر
العدد
المجلد 2018، العدد 2018 (31 ديسمبر/كانون الأول 2018)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2018-08-14
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Confident characterization of intact glycopeptides is a challenging task in mass spectrometry-based glycoproteomics due to microheterogeneity of glycosylation, complexity of glycans, and insufficient fragmentation of peptide bones.
Open mass spectral library search is a promising computational approach to peptide identification, but its potential in the identification of glycopeptides has not been fully explored.
Here we present pMatchGlyco, a new spectral library search tool for intact N-linked glycopeptide identification using high-energy collisional dissociation (HCD) tandem mass spectrometry (MS/MS) data.
In pMatchGlyco, (1) MS/MS spectra of deglycopeptides are used to create spectral library, (2) MS/MS spectra of glycopeptides are matched to the spectra in library in an open (precursor tolerant) manner and the glycans are inferred, and (3) a false discovery rate is estimated for top-scored matches above a threshold.
The efficiency and reliability of pMatchGlyco were demonstrated on a data set of mixture sample of six standard glycoproteins and a complex glycoprotein data set generated from human cancer cell line OVCAR3.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
An, Zhiwu& Shu, Qingbo& Lv, Hao& Shu, Lian& Wang, Jifeng& Yang, Fuquan…[et al.]. 2018. N-Linked Glycopeptide Identification Based on Open Mass Spectral Library Search. BioMed Research International،Vol. 2018, no. 2018, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124458
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
An, Zhiwu…[et al.]. N-Linked Glycopeptide Identification Based on Open Mass Spectral Library Search. BioMed Research International No. 2018 (2018), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124458
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
An, Zhiwu& Shu, Qingbo& Lv, Hao& Shu, Lian& Wang, Jifeng& Yang, Fuquan…[et al.]. N-Linked Glycopeptide Identification Based on Open Mass Spectral Library Search. BioMed Research International. 2018. Vol. 2018, no. 2018, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1124458
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1124458
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)