![](/images/graphics-bg.png)
Detection of False-Positive Deletions from the Database of Genomic Variants
المؤلفون المشاركون
Yuan, Xiguo
Duan, Junbo
Liu, Han
Zhao, Lanling
Wang, Yu-Ping
Wan, Mingxi
المصدر
العدد
المجلد 2019، العدد 2019 (31 ديسمبر/كانون الأول 2019)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2019-04-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Next generation sequencing is an emerging technology that has been widely used in the detection of genomic variants.
However, since its depth of coverage, a main signature used for variant calling, is affected greatly by biases such as GC content and mappability, some callings are false positives.
In this study, we utilized paired-end read mapping, another signature that is not affected by the aforementioned biases, to detect false-positive deletions in the database of genomic variants.
We first identified 1923 suspicious variants that may be false positives and then conducted validation studies on each suspicious variant, which detected 583 false-positive deletions.
Finally we analysed the distribution of these false positives by chromosome, sample, and size.
Hopefully, incorrect documentation and annotations in downstream studies can be avoided by correcting these false positives in public repositories.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Duan, Junbo& Liu, Han& Zhao, Lanling& Yuan, Xiguo& Wang, Yu-Ping& Wan, Mingxi. 2019. Detection of False-Positive Deletions from the Database of Genomic Variants. BioMed Research International،Vol. 2019, no. 2019, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1127906
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Duan, Junbo…[et al.]. Detection of False-Positive Deletions from the Database of Genomic Variants. BioMed Research International No. 2019 (2019), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1127906
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Duan, Junbo& Liu, Han& Zhao, Lanling& Yuan, Xiguo& Wang, Yu-Ping& Wan, Mingxi. Detection of False-Positive Deletions from the Database of Genomic Variants. BioMed Research International. 2019. Vol. 2019, no. 2019, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1127906
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1127906
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)