An Integrative Computational Approach for the Prediction of Human-Plasmodium Protein-Protein Interactions
المؤلفون المشاركون
Ghedira, Kais
Hamdi, Yosr
El Béji, Abir
Othman, Houcemeddine
المصدر
العدد
المجلد 2020، العدد 2020 (31 ديسمبر/كانون الأول 2020)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2020-12-21
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Host-pathogen molecular cross-talks are critical in determining the pathophysiology of a specific infection.
Most of these cross-talks are mediated via protein-protein interactions between the host and the pathogen (HP-PPI).
Thus, it is essential to know how some pathogens interact with their hosts to understand the mechanism of infections.
Malaria is a life-threatening disease caused by an obligate intracellular parasite belonging to the Plasmodium genus, of which P.
falciparum is the most prevalent.
Several previous studies predicted human-plasmodium protein-protein interactions using computational methods have demonstrated their utility, accuracy, and efficiency to identify the interacting partners and therefore complementing experimental efforts to characterize host-pathogen interaction networks.
To predict potential putative HP-PPIs, we use an integrative computational approach based on the combination of multiple OMICS-based methods including human red blood cells (RBC) and Plasmodium falciparum 3D7 strain expressed proteins, domain-domain based PPI, similarity of gene ontology terms, structure similarity method homology identification, and machine learning prediction.
Our results reported a set of 716 protein interactions involving 302 human proteins and 130 Plasmodium proteins.
This work provides a list of potential human-Plasmodium interacting proteins.
These findings will contribute to better understand the mechanisms underlying the molecular determinism of malaria disease and potentially to identify candidate pharmacological targets.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Ghedira, Kais& Hamdi, Yosr& El Béji, Abir& Othman, Houcemeddine. 2020. An Integrative Computational Approach for the Prediction of Human-Plasmodium Protein-Protein Interactions. BioMed Research International،Vol. 2020, no. 2020, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1132301
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Ghedira, Kais…[et al.]. An Integrative Computational Approach for the Prediction of Human-Plasmodium Protein-Protein Interactions. BioMed Research International No. 2020 (2020), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1132301
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Ghedira, Kais& Hamdi, Yosr& El Béji, Abir& Othman, Houcemeddine. An Integrative Computational Approach for the Prediction of Human-Plasmodium Protein-Protein Interactions. BioMed Research International. 2020. Vol. 2020, no. 2020, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1132301
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1132301
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر