![](/images/graphics-bg.png)
IMPContact: An Interhelical Residue Contact Prediction Method
المؤلفون المشاركون
Wang, Han
Hu, LiHong
Lu, Ying Hua
Fang, Chao
Jia, Yajie
المصدر
العدد
المجلد 2020، العدد 2020 (31 ديسمبر/كانون الأول 2020)، ص ص. 1-10، 10ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2020-03-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
10
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
As an important category of proteins, alpha-helix transmembrane proteins (αTMPs) play an important role in various biological activities.
Because the solved αTMP structures are inadequate, predicting the residue contacts among the transmembrane segments of an αTMP exhibits the basis of protein fold, which can be used to further discover more protein functions.
A few efforts have been devoted to predict the interhelical residue contact using machine learning methods based on the prior knowledge of transmembrane protein structure.
However, it is still a challenge to improve the prediction accuracy, while the deep learning method provides an opportunity to utilize the structural knowledge in a different insight.
For this purpose, we proposed a novel αTMP residue-residue contact prediction method IMPContact, in which a convolutional neural network (CNN) was applied to recognize those interhelical contacts in a TMP using its specific structural features.
There were four sequence-based TMP-specific features selected to descript a pair of residues, namely, evolutionary covariation, predicted topology structure, residue relative position, and evolutionary conservation.
An up-to-date dataset was used to train and test the IMPContact; our method achieved better performance compared to peer methods.
In the case studies, IHRCs in the regular transmembrane helixes were better predicted than in the irregular ones.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Fang, Chao& Jia, Yajie& Hu, LiHong& Lu, Ying Hua& Wang, Han. 2020. IMPContact: An Interhelical Residue Contact Prediction Method. BioMed Research International،Vol. 2020, no. 2020, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1133997
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Fang, Chao…[et al.]. IMPContact: An Interhelical Residue Contact Prediction Method. BioMed Research International No. 2020 (2020), pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1133997
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Fang, Chao& Jia, Yajie& Hu, LiHong& Lu, Ying Hua& Wang, Han. IMPContact: An Interhelical Residue Contact Prediction Method. BioMed Research International. 2020. Vol. 2020, no. 2020, pp.1-10.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1133997
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1133997
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)