Integrating Genome-Wide Association and eQTLs Studies Identifies the Genes and Gene Sets Associated with Diabetes
المؤلفون المشاركون
Wen, Yan
He, Awen
Liang, Xiao
Wang, Wenyu
Liu, Li
Du, Yanan
Fan, Qianrui
Li, Ping
Hao, Jingcan
Guo, Xiong
Zhang, Feng
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-4، 4ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-06-28
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
4
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Aim.
To identify novel candidate genes and gene sets for diabetes.
Methods.
We performed an integrative analysis of genome-wide association studies (GWAS) and expression quantitative trait loci (eQTLs) data for diabetes.
Summary data was driven from a large-scale GWAS of diabetes, totally involving 58,070 individuals.
eQTLs dataset included 923,021 cis-eQTL for 14,329 genes and 4,732 trans-eQTL for 2,612 genes.
Integrative analysis of GWAS and eQTLs data was conducted by summary data-based Mendelian randomization (SMR).
To identify the gene sets associated with diabetes, the SMR single gene analysis results were further subjected to gene set enrichment analysis (GSEA).
A total of 13,311 annotated gene sets were analyzed in this study.
Results.
SMR analysis identified 6 genes significantly associated with fasting glucose, such as C11ORF10 (p value = 6.04 × 10−8), MRPL33 (p value = 1.24 × 10−7), and FADS1 (p value = 2.39 × 10−7).
Gene set analysis identified HUANG_FOXA2_TARGETS_UP (false discovery rate = 0.047) associated with fasting glucose.
Conclusion.
Our study provides novel clues for clarifying the genetic mechanism of diabetes.
This study also illustrated the good performance of SMR approach and extended it to gene set association analysis for complex diseases.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Liang, Xiao& He, Awen& Wang, Wenyu& Liu, Li& Du, Yanan& Fan, Qianrui…[et al.]. 2017. Integrating Genome-Wide Association and eQTLs Studies Identifies the Genes and Gene Sets Associated with Diabetes. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-4.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1134171
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Liang, Xiao…[et al.]. Integrating Genome-Wide Association and eQTLs Studies Identifies the Genes and Gene Sets Associated with Diabetes. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-4.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1134171
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Liang, Xiao& He, Awen& Wang, Wenyu& Liu, Li& Du, Yanan& Fan, Qianrui…[et al.]. Integrating Genome-Wide Association and eQTLs Studies Identifies the Genes and Gene Sets Associated with Diabetes. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-4.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1134171
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1134171
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر