Identification of Key Genes in Gastric Cancer by Bioinformatics Analysis
المؤلفون المشاركون
Zhang, Luyu
Peng, Rui
Chong, Xinyu
Zhang, Zheng
Sun, Yan
المصدر
العدد
المجلد 2020، العدد 2020 (31 ديسمبر/كانون الأول 2020)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2020-09-21
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Gastric cancer (GC) is one of the most common malignancies of the digestive system with few genetic markers for its early detection and prevention.
In this study, differentially expressed genes (DEGs) were analyzed using GEO2R from GSE54129 and GSE13911 of the Gene Expression Omnibus (GEO).
Then, gene enrichment analysis, protein-protein interaction (PPI) network construction, and topological analysis were performed on the DEGs by the Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway, STRING, and Cytoscape.
Finally, we performed survival analysis of key genes through the Kaplan-Meier plotter.
A total of 1034 DEGs were identified in GC.
GO and KEGG results showed that DEGs mainly enriched in plasma membrane, cell adhesion, and PI3K-Akt signaling pathway.
Subsequently, the PPI network with 44 nodes and 333 edges was constructed, and 18 candidate genes in the network were focused on by centrality analysis and module analysis.
Furthermore, data showed that high expressions of fibronectin 1(FN1), the tissue inhibitor of metalloproteinases 1 (TIMP1), secreted phosphoprotein 1 (SPP1), apolipoprotein E (APOE), and versican (VCAN) were related to poor overall survivals in GC patients.
In summary, this study suggests that FN1, TIMP1, SPP1, APOE, and VCAN may act as the key genes in GC.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Chong, Xinyu& Peng, Rui& Sun, Yan& Zhang, Luyu& Zhang, Zheng. 2020. Identification of Key Genes in Gastric Cancer by Bioinformatics Analysis. BioMed Research International،Vol. 2020, no. 2020, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137129
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Chong, Xinyu…[et al.]. Identification of Key Genes in Gastric Cancer by Bioinformatics Analysis. BioMed Research International No. 2020 (2020), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137129
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Chong, Xinyu& Peng, Rui& Sun, Yan& Zhang, Luyu& Zhang, Zheng. Identification of Key Genes in Gastric Cancer by Bioinformatics Analysis. BioMed Research International. 2020. Vol. 2020, no. 2020, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137129
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137129
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر