The Combination of Computational and Biosensing Technologies for Selecting Aptamer against Prostate Specific Antigen
المؤلفون المشاركون
Hu, Wen-Pin
Hsieh, Pi-Chou
Lin, Hui-Ting
Chen, Wen-Yih
Tsai, Jeffrey J. P.
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-03-28
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Herein, we report a method of combining bioinformatics and biosensing technologies to select aptamers against prostate specific antigen (PSA).
The main objective of this study is to select DNA aptamers with higher binding affinity for PSA by using the proposed method.
Based on the five known sequences of PSA-binding aptamers, we adopted the functions of reproduction and crossover in the genetic algorithm to produce next-generation sequences for the computational and experimental analysis.
RNAfold web server was utilized to analyze the secondary structures, and the 3-dimensional molecular models of aptamer sequences were generated by using RNAComposer web server.
ZRANK scoring function was used to rerank the docking predictions from ZDOCK.
The biosensors, the quartz crystal microbalance (QCM) and a surface plasmon resonance (SPR) instrument, were used to verify the binding ability of selected aptamer for PSA.
By carrying out the simulations and experiments after two generations, we obtain one aptamer that can have the highest binding affinity with PSA, which generates almost 2-fold and 3-fold greater measured signals than the responses produced by the best known DNA sequence in the QCM and SPR experiments, respectively.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hsieh, Pi-Chou& Lin, Hui-Ting& Chen, Wen-Yih& Tsai, Jeffrey J. P.& Hu, Wen-Pin. 2017. The Combination of Computational and Biosensing Technologies for Selecting Aptamer against Prostate Specific Antigen. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137392
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hsieh, Pi-Chou…[et al.]. The Combination of Computational and Biosensing Technologies for Selecting Aptamer against Prostate Specific Antigen. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137392
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hsieh, Pi-Chou& Lin, Hui-Ting& Chen, Wen-Yih& Tsai, Jeffrey J. P.& Hu, Wen-Pin. The Combination of Computational and Biosensing Technologies for Selecting Aptamer against Prostate Specific Antigen. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137392
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137392
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر