Robust Significance Analysis of Microarrays by Minimum β-Divergence Method
المؤلفون المشاركون
Kumar, Nishith
Ahmed, Md. Shakil
Shahjaman, Md.
Mollah, Md. Nurul Haque
Mollah, Md. Manir Hossain
Ara Begum, Anjuman
Shahinul Islam, S. M.
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-18، 18ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-07-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
18
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Identification of differentially expressed (DE) genes with two or more conditions is an important task for discovery of few biomarker genes.
Significance Analysis of Microarrays (SAM) is a popular statistical approach for identification of DE genes for both small- and large-sample cases.
However, it is sensitive to outlying gene expressions and produces low power in presence of outliers.
Therefore, in this paper, an attempt is made to robustify the SAM approach using the minimum β-divergence estimators instead of the maximum likelihood estimators of the parameters.
We demonstrated the performance of the proposed method in a comparison of some other popular statistical methods such as ANOVA, SAM, LIMMA, KW, EBarrays, GaGa, and BRIDGE using both simulated and real gene expression datasets.
We observe that all methods show good and almost equal performance in absence of outliers for the large-sample cases, while in the small-sample cases only three methods (SAM, LIMMA, and proposed) show almost equal and better performance than others with two or more conditions.
However, in the presence of outliers, on an average, only the proposed method performs better than others for both small- and large-sample cases with each condition.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Shahjaman, Md.& Kumar, Nishith& Mollah, Md. Manir Hossain& Ahmed, Md. Shakil& Ara Begum, Anjuman& Shahinul Islam, S. M.…[et al.]. 2017. Robust Significance Analysis of Microarrays by Minimum β-Divergence Method. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137547
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Shahjaman, Md.…[et al.]. Robust Significance Analysis of Microarrays by Minimum β-Divergence Method. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137547
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Shahjaman, Md.& Kumar, Nishith& Mollah, Md. Manir Hossain& Ahmed, Md. Shakil& Ara Begum, Anjuman& Shahinul Islam, S. M.…[et al.]. Robust Significance Analysis of Microarrays by Minimum β-Divergence Method. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-18.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137547
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137547
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر