![](/images/graphics-bg.png)
COPAR: A ChIP-Seq Optimal Peak Analyzer
المؤلفون المشاركون
Tang, Binhua
Wang, Xihan
Jin, Victor X.
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-4، 4ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-03-05
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
4
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Sequencing data quality and peak alignment efficiency of ChIP-sequencing profiles are directly related to the reliability and reproducibility of NGS experiments.
Till now, there is no tool specifically designed for optimal peak alignment estimation and quality-related genomic feature extraction for ChIP-sequencing profiles.
We developed open-sourced COPAR, a user-friendly package, to statistically investigate, quantify, and visualize the optimal peak alignment and inherent genomic features using ChIP-seq data from NGS experiments.
It provides a versatile perspective for biologists to perform quality-check for high-throughput experiments and optimize their experiment design.
The package COPAR can process mapped ChIP-seq read file in BED format and output statistically sound results for multiple high-throughput experiments.
Together with three public ChIP-seq data sets verified with the developed package, we have deposited COPAR on GitHub under a GNU GPL license.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Tang, Binhua& Wang, Xihan& Jin, Victor X.. 2017. COPAR: A ChIP-Seq Optimal Peak Analyzer. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-4.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137579
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Tang, Binhua…[et al.]. COPAR: A ChIP-Seq Optimal Peak Analyzer. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-4.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137579
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Tang, Binhua& Wang, Xihan& Jin, Victor X.. COPAR: A ChIP-Seq Optimal Peak Analyzer. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-4.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137579
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137579
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)