An Improved Binary Differential Evolution Algorithm to Infer Tumor Phylogenetic Trees
المؤلفون المشاركون
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-13، 13ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-11-27
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
13
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Tumourigenesis is a mutation accumulation process, which is likely to start with a mutated founder cell.
The evolutionary nature of tumor development makes phylogenetic models suitable for inferring tumor evolution through genetic variation data.
Copy number variation (CNV) is the major genetic marker of the genome with more genes, disease loci, and functional elements involved.
Fluorescence in situ hybridization (FISH) accurately measures multiple gene copy number of hundreds of single cells.
We propose an improved binary differential evolution algorithm, BDEP, to infer tumor phylogenetic tree based on FISH platform.
The topology analysis of tumor progression tree shows that the pathway of tumor subcell expansion varies greatly during different stages of tumor formation.
And the classification experiment shows that tree-based features are better than data-based features in distinguishing tumor.
The constructed phylogenetic trees have great performance in characterizing tumor development process, which outperforms other similar algorithms.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Liang, Ying& Liao, Bo& Zhu, Wen. 2017. An Improved Binary Differential Evolution Algorithm to Infer Tumor Phylogenetic Trees. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137658
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Liang, Ying…[et al.]. An Improved Binary Differential Evolution Algorithm to Infer Tumor Phylogenetic Trees. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137658
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Liang, Ying& Liao, Bo& Zhu, Wen. An Improved Binary Differential Evolution Algorithm to Infer Tumor Phylogenetic Trees. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1137658
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1137658
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر