A Review on Recent Computational Methods for Predicting Noncoding RNAs
المؤلفون المشاركون
Yang, Jialiang
Zhang, Yi
Huang, Haiyun
Zhang, Dahan
Qiu, Jing
Yang, Jiasheng
Wang, Kejing
Zhu, Lijuan
Fan, Jingjing
المصدر
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-14، 14ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-05-03
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Noncoding RNAs (ncRNAs) play important roles in various cellular activities and diseases.
In this paper, we presented a comprehensive review on computational methods for ncRNA prediction, which are generally grouped into four categories: (1) homology-based methods, that is, comparative methods involving evolutionarily conserved RNA sequences and structures, (2) de novo methods using RNA sequence and structure features, (3) transcriptional sequencing and assembling based methods, that is, methods designed for single and pair-ended reads generated from next-generation RNA sequencing, and (4) RNA family specific methods, for example, methods specific for microRNAs and long noncoding RNAs.
In the end, we summarized the advantages and limitations of these methods and pointed out a few possible future directions for ncRNA prediction.
In conclusion, many computational methods have been demonstrated to be effective in predicting ncRNAs for further experimental validation.
They are critical in reducing the huge number of potential ncRNAs and pointing the community to high confidence candidates.
In the future, high efficient mapping technology and more intrinsic sequence features (e.g., motif and k-mer frequencies) and structure features (e.g., minimum free energy, conserved stem-loop, or graph structures) are suggested to be combined with the next- and third-generation sequencing platforms to improve ncRNA prediction.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Zhang, Yi& Huang, Haiyun& Zhang, Dahan& Qiu, Jing& Yang, Jiasheng& Wang, Kejing…[et al.]. 2017. A Review on Recent Computational Methods for Predicting Noncoding RNAs. BioMed Research International،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1139351
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Zhang, Yi…[et al.]. A Review on Recent Computational Methods for Predicting Noncoding RNAs. BioMed Research International No. 2017 (2017), pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1139351
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Zhang, Yi& Huang, Haiyun& Zhang, Dahan& Qiu, Jing& Yang, Jiasheng& Wang, Kejing…[et al.]. A Review on Recent Computational Methods for Predicting Noncoding RNAs. BioMed Research International. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-14.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1139351
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1139351
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر