![](/images/graphics-bg.png)
A Robust Metatranscriptomic Technology for Population-Scale Studies of Diet, Gut Microbiome, and Human Health
المؤلفون المشاركون
Hatch, Andrew
Horne, James
Toma, Ryan
Twibell, Brittany L.
Somerville, Kalie M.
Pelle, Benjamin
Canfield, Kinga P.
Genkin, Matvey
Banavar, Guruduth
Perlina, Ally
Messier, Helen
Klitgord, Niels
Vuyisich, Momchilo
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2019، العدد 2019 (31 ديسمبر/كانون الأول 2019)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2019-10-01
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
A functional readout of the gut microbiome is necessary to enable precise control of the gut microbiome’s functions, which support human health and prevent or minimize a wide range of chronic diseases.
Stool metatranscriptomic analysis offers a comprehensive functional view of the gut microbiome, but despite its usefulness, it has rarely been used in clinical studies due to its complexity, cost, and bioinformatic challenges.
This method has also received criticism due to potential intrasample variability, rapid changes, and RNA degradation.
Here, we describe a robust and automated stool metatranscriptomic method, called Viomega, which was specifically developed for population-scale studies.
Viomega includes sample collection, ambient temperature sample preservation, total RNA extraction, physical removal of ribosomal RNAs (rRNAs), preparation of directional Illumina libraries, Illumina sequencing, taxonomic classification based on a database of >110,000 microbial genomes, and quantitative microbial gene expression analysis using a database of ~100 million microbial genes.
We applied this method to 10,000 human stool samples and performed several small-scale studies to demonstrate sample stability and consistency.
In summary, Viomega is an inexpensive, high-throughput, automated, and accurate sample-to-result stool metatranscriptomic technology platform for large-scale studies and a wide range of applications.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hatch, Andrew& Horne, James& Toma, Ryan& Twibell, Brittany L.& Somerville, Kalie M.& Pelle, Benjamin…[et al.]. 2019. A Robust Metatranscriptomic Technology for Population-Scale Studies of Diet, Gut Microbiome, and Human Health. International Journal of Genomics،Vol. 2019, no. 2019, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1165497
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hatch, Andrew…[et al.]. A Robust Metatranscriptomic Technology for Population-Scale Studies of Diet, Gut Microbiome, and Human Health. International Journal of Genomics No. 2019 (2019), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1165497
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hatch, Andrew& Horne, James& Toma, Ryan& Twibell, Brittany L.& Somerville, Kalie M.& Pelle, Benjamin…[et al.]. A Robust Metatranscriptomic Technology for Population-Scale Studies of Diet, Gut Microbiome, and Human Health. International Journal of Genomics. 2019. Vol. 2019, no. 2019, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1165497
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1165497
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)