Distribution, Characteristics, and Regulatory Potential of Long Noncoding RNAs in Brown-Rot Fungi
المؤلفون المشاركون
Borgognone, Alessandra
Sanseverino, Walter
Aiese Cigliano, Riccardo
Castanera, Raúl
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2019، العدد 2019 (31 ديسمبر/كانون الأول 2019)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2019-05-02
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Long noncoding RNAs have been thoroughly studied in plants, animals, and yeasts, where they play important roles as regulators of transcription.
Nevertheless, almost nothing is known about their presence and characteristics in filamentous fungi, especially in basidiomycetes.
In the present study, we have carried out an exhaustive annotation and characterization of lncRNAs in two lignin degrader basidiomycetes, Coniophora puteana and Serpula lacrymans.
We identified 2,712 putative lncRNAs in the former and 2,242 in the latter, mainly originating from intergenic locations of transposon-sparse genomic regions.
The lncRNA length, GC content, expression levels, and stability of the secondary structure differ from coding transcripts but are similar in these two species and resemble that of other eukaryotes.
Nevertheless, they lack sequence conservation.
Also, we found that lncRNAs are transcriptionally regulated in the same proportion as genes when the fungus actively decomposes soil organic matter.
Finally, up to 7% of the upstream gene regions of Coniophora puteana and Serpula lacrymans are transcribed and produce lncRNAs.
The study of expression trends in these gene-lncRNA pairs uncovered groups with similar and opposite transcriptional profiles which may be the result of cis-transcriptional regulation.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Borgognone, Alessandra& Sanseverino, Walter& Aiese Cigliano, Riccardo& Castanera, Raúl. 2019. Distribution, Characteristics, and Regulatory Potential of Long Noncoding RNAs in Brown-Rot Fungi. International Journal of Genomics،Vol. 2019, no. 2019, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1165817
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Borgognone, Alessandra…[et al.]. Distribution, Characteristics, and Regulatory Potential of Long Noncoding RNAs in Brown-Rot Fungi. International Journal of Genomics No. 2019 (2019), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1165817
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Borgognone, Alessandra& Sanseverino, Walter& Aiese Cigliano, Riccardo& Castanera, Raúl. Distribution, Characteristics, and Regulatory Potential of Long Noncoding RNAs in Brown-Rot Fungi. International Journal of Genomics. 2019. Vol. 2019, no. 2019, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1165817
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1165817
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر