![](/images/graphics-bg.png)
Characteristics and Validation Techniques for PCA-Based Gene-Expression Signatures
المؤلفون المشاركون
Berglund, Anders E.
Welsh, Eric A.
Eschrich, Steven A.
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2017، العدد 2017 (31 ديسمبر/كانون الأول 2017)، ص ص. 1-13، 13ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2017-02-06
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
13
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Background.
Many gene-expression signatures exist for describing the biological state of profiled tumors.
Principal Component Analysis (PCA) can be used to summarize a gene signature into a single score.
Our hypothesis is that gene signatures can be validated when applied to new datasets, using inherent properties of PCA.
Results.
This validation is based on four key concepts.
Coherence: elements of a gene signature should be correlated beyond chance.
Uniqueness: the general direction of the data being examined can drive most of the observed signal.
Robustness: if a gene signature is designed to measure a single biological effect, then this signal should be sufficiently strong and distinct compared to other signals within the signature.
Transferability: the derived PCA gene signature score should describe the same biology in the target dataset as it does in the training dataset.
Conclusions.
The proposed validation procedure ensures that PCA-based gene signatures perform as expected when applied to datasets other than those that the signatures were trained upon.
Complex signatures, describing multiple independent biological components, are also easily identified.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Berglund, Anders E.& Welsh, Eric A.& Eschrich, Steven A.. 2017. Characteristics and Validation Techniques for PCA-Based Gene-Expression Signatures. International Journal of Genomics،Vol. 2017, no. 2017, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1167003
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Berglund, Anders E.…[et al.]. Characteristics and Validation Techniques for PCA-Based Gene-Expression Signatures. International Journal of Genomics No. 2017 (2017), pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1167003
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Berglund, Anders E.& Welsh, Eric A.& Eschrich, Steven A.. Characteristics and Validation Techniques for PCA-Based Gene-Expression Signatures. International Journal of Genomics. 2017. Vol. 2017, no. 2017, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1167003
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1167003
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)