![](/images/graphics-bg.png)
FcircSEC: An R Package for Full Length circRNA Sequence Extraction and Classification
المؤلفون المشاركون
Feng, Shengzhong
Hossain, Md. Tofazzal
Peng, Yin
Wei, Yanjie
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2020، العدد 2020 (31 ديسمبر/كانون الأول 2020)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2020-06-01
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Circular RNAs (circRNAs) are formed by joining the 3′ and 5′ ends of RNA molecules.
Identification of circRNAs is an important part of circRNA research.
The circRNA prediction methods can predict the circRNAs with start and end positions in the chromosome but cannot identify the full-length circRNA sequences.
We present an R package FcircSEC (Full Length circRNA Sequence Extraction and Classification) to extract the full-length circRNA sequences based on gene annotation and the output of any circRNA prediction tools whose output has a chromosome, start and end positions, and a strand for each circRNA.
To validate FcircSEC, we have used three databases, circbase, circRNAdb, and plantcircbase.
With information such as the chromosome and strand of each circRNA as the input, the identified sequences by FcircSEC are consistent with the databases.
The novelty of FcircSEC is that it can take the output of state-of-the-art circRNA prediction tools as input and is applicable for human and other species.
We also classify the circRNAs as exonic, intronic, and others.
The R package FcircSEC is freely available.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Hossain, Md. Tofazzal& Peng, Yin& Feng, Shengzhong& Wei, Yanjie. 2020. FcircSEC: An R Package for Full Length circRNA Sequence Extraction and Classification. International Journal of Genomics،Vol. 2020, no. 2020, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1171340
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Hossain, Md. Tofazzal…[et al.]. FcircSEC: An R Package for Full Length circRNA Sequence Extraction and Classification. International Journal of Genomics No. 2020 (2020), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1171340
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Hossain, Md. Tofazzal& Peng, Yin& Feng, Shengzhong& Wei, Yanjie. FcircSEC: An R Package for Full Length circRNA Sequence Extraction and Classification. International Journal of Genomics. 2020. Vol. 2020, no. 2020, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1171340
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1171340
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)