Regulation of Long Noncoding RNAs Responsive to Phytoplasma Infection in Paulownia tomentosa
المؤلفون المشاركون
Wang, Zhe
Cao, Xibing
Fan, Guoqiang
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2018، العدد 2018 (31 ديسمبر/كانون الأول 2018)، ص ص. 1-16، 16ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2018-02-21
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
16
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Paulownia witches’ broom caused by phytoplasma infection affects the production of Paulownia trees worldwide.
Emerging evidence showed that long noncoding RNAs (lncRNA) play a protagonist role in regulating the expression of genes in plants.
So far, the identification of lncRNAs has been limited to a few model plant species, and their roles in mediating responses to Paulownia tomentosa that free of phytoplasma infection are yet to be characterized.
Here, whole-genome identification of lncRNAs, based on strand-specific RNA sequencing, from four Paulownia tomentosa samples, was performed and identified 3689 lncRNAs.
These lncRNAs showed low conservation among plant species and some of them were miRNA precursors.
Further analysis revealed that the 112 identified lncRNAs were related to phytoplasma infection.
We predicted the target genes of these phytoplasma-responsive lncRNAs, and our analysis showed that 51 of the predicted target genes were alternatively spliced.
Moreover, we found the expression of the lncRNAs plays vital roles in regulating the genes involved in the reactive oxygen species induced hypersensitive response and effector-triggered immunity in phytoplasma-infected Paulownia.
This study indicated that diverse sets of lncRNAs were responsive to Paulownia witches’ broom, and the results will provide a starting point to understand the functions and regulatory mechanisms of Paulownia lncRNAs in the future.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Fan, Guoqiang& Cao, Xibing& Wang, Zhe. 2018. Regulation of Long Noncoding RNAs Responsive to Phytoplasma Infection in Paulownia tomentosa. International Journal of Genomics،Vol. 2018, no. 2018, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172713
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Fan, Guoqiang…[et al.]. Regulation of Long Noncoding RNAs Responsive to Phytoplasma Infection in Paulownia tomentosa. International Journal of Genomics No. 2018 (2018), pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172713
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Fan, Guoqiang& Cao, Xibing& Wang, Zhe. Regulation of Long Noncoding RNAs Responsive to Phytoplasma Infection in Paulownia tomentosa. International Journal of Genomics. 2018. Vol. 2018, no. 2018, pp.1-16.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172713
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1172713
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر