Detecting Differentially Variable MicroRNAs via Model-Based Clustering
المؤلفون المشاركون
Fu, Yuejiao
Li, Xuan
Wang, Xiaogang
DeMeo, Dawn L.
Tantisira, Kelan
Weiss, Scott T.
Qiu, Weiliang
المصدر
International Journal of Genomics
العدد
المجلد 2018، العدد 2018 (31 ديسمبر/كانون الأول 2018)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2018-07-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Identifying differentially variable (DV) genomic probes is becoming a new approach to detect novel genomic risk factors for complex human diseases.
The F test is the standard equal-variance test in statistics.
For high-throughput genomic data, the probe-wise F test has been successfully used to detect biologically relevant DNA methylation marks that have different variances between two groups of subjects (e.g., cases versus controls).
In addition to DNA methylation, microRNA (miRNA) is another important mechanism of epigenetics.
However, to the best of our knowledge, no studies have identified DV miRNAs.
In this article, we proposed a novel model-based clustering method to improve the power of the probe-wise F test to detect DV miRNAs.
We imposed special structures on covariance matrices for each cluster of miRNAs based on the prior information about the relationship between variances in cases and controls and about the independence among them.
Simulation studies showed that the proposed method seems promising in detecting DV probes.
Based on two real datasets about human hepatocellular carcinoma (HCC), we identified 7 DV-only miRNAs (hsa-miR-1826, hsa-miR-191, hsa-miR-194-star, hsa-miR-222, hsa-miR-502-3p, hsa-miR-93, and hsa-miR-99b) using the proposed method, one (hsa-miR-1826) of which has not yet been reported to be related to HCC in the literature.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Li, Xuan& Fu, Yuejiao& Wang, Xiaogang& DeMeo, Dawn L.& Tantisira, Kelan& Weiss, Scott T.…[et al.]. 2018. Detecting Differentially Variable MicroRNAs via Model-Based Clustering. International Journal of Genomics،Vol. 2018, no. 2018, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172811
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Li, Xuan…[et al.]. Detecting Differentially Variable MicroRNAs via Model-Based Clustering. International Journal of Genomics No. 2018 (2018), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172811
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Li, Xuan& Fu, Yuejiao& Wang, Xiaogang& DeMeo, Dawn L.& Tantisira, Kelan& Weiss, Scott T.…[et al.]. Detecting Differentially Variable MicroRNAs via Model-Based Clustering. International Journal of Genomics. 2018. Vol. 2018, no. 2018, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1172811
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1172811
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر