Bioinformatic Identification of Neuroblastoma Microenvironment-Associated Biomarkers with Prognostic Value
المؤلفون المشاركون
Cao, Jing
Ma, Chao
Luo, Huan
Wang, Yi
المصدر
العدد
المجلد 2020، العدد 2020 (31 ديسمبر/كانون الأول 2020)، ص ص. 1-13، 13ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2020-09-10
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
13
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
The microenvironment plays a vital role in the tumor recurrence of neuroblastoma.
This research aimed at exploring prognostic genes that are involved in neuroblastoma microenvironment.
We used “estimate” R package to calculate the immune/stromal/ESTIMATE scores of each sample of ArrayExpress dataset E-MTAB-8248 based on the ESTIMATE algorithm.
Then we found that immune/stromal/ESTIMATE scores were not correlated with age/chromosome 11q, but tumor stage, MYCN gene amplifications, and chromosome 1p.
Samples were then divided into high- and low-score groups, and 280 common differentially expressed genes (DEGs) were identified.
64 potential prognostic genes were harvested through overall survival analysis from the common DEGs.
14 prognostic genes (ABCA6, SEPP1, SLAMF8, GPR171, ABCA9, ARHGAP15, IL7R, HLA-DPB1, GZMA, GPR183, CCL19, ITK, FGL2, and CD1C) were obtained after screening in two independent cohorts.
GO and KEGG analysis discovered that common DEGs and 64 potential prognostic genes are mainly involved in T-cell activation, lymphocyte activation regulation, leukocyte migration, and the interaction of cytokines and cytokine receptors.
Correlation analysis showed that all prognostic genes were negatively correlated with MYCN amplification.
Cox analysis identified 5 independent prognostic genes (ARHGAP15, ABCA9, CCL19, SLAMF8, and CD1C).
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Wang, Yi& Luo, Huan& Cao, Jing& Ma, Chao. 2020. Bioinformatic Identification of Neuroblastoma Microenvironment-Associated Biomarkers with Prognostic Value. Journal of Oncology،Vol. 2020, no. 2020, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1189006
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Wang, Yi…[et al.]. Bioinformatic Identification of Neuroblastoma Microenvironment-Associated Biomarkers with Prognostic Value. Journal of Oncology No. 2020 (2020), pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1189006
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Wang, Yi& Luo, Huan& Cao, Jing& Ma, Chao. Bioinformatic Identification of Neuroblastoma Microenvironment-Associated Biomarkers with Prognostic Value. Journal of Oncology. 2020. Vol. 2020, no. 2020, pp.1-13.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-1189006
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-1189006
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر