Study of optimum conditions in detection of ABO genotype by simultaneous PCR-RFLP method

العناوين الأخرى

دراسة الظروف المثلى لتشخيص أنماط الوراثية لمجاميع الدم ABO باستخدام طريقة PCR-RFLP

المؤلفون المشاركون

al-Tai, Muhammad Ibrahim Nadir Mahmud
Muhammad, Ahmad Kazim
Umar, Amirah Jabir

المصدر

Iraqi Journal of Science

العدد

المجلد 51، العدد 4 (31 ديسمبر/كانون الأول 2010)، ص ص. 588-597، 10ص.

الناشر

جامعة بغداد كلية العلوم

تاريخ النشر

2010-12-31

دولة النشر

العراق

عدد الصفحات

10

التخصصات الرئيسية

الأحياء

الموضوعات

الملخص AR

عزلت المادة الوراثية بطريقتين، الطريقة اليدوية باستخدام عدة العزل و كانت ذات تركيز عالي نسبيا (10-5 ميكروغرام) لكنها بنقاوة دون المثالية (3.3-0.9).

ضبط تركيز المادة الوراثية بما يتلائم طريقة تفاعل التضاعف التسلسلي (PCR).

تم مضاعفة قطعتان من جين ABO، القطعة الأولى في الأكسون 6 تتضمن النيوكليوتيد 261، والقطعة الثانية في الأكسون 7 و المتضمنة الينيوكليوتيد 703 (جين ABO يتكون من 7 أكسونات و 6 انترونات) باستخدام تسلسلات من بادئ البلمرة (Primers) مخصصة لمضاعفة قطعتان تمثل جين ABO بجميع آلياته.

المجموعة الأول يتضمن زوج البوادئ (1،2) التي نتج من مضاعفة القطعة الأولى 200 زوج قاعد و الذي يتضمن النيوكليوتيدات 261 بينما نتج عن المجموعة الثانية من زوج البوادئ (2،3) مضاعفة القطعة 128 زوج قاعدة والمتضمنة النية كليوتيدات 703.

فصلت نواتج PCR على 2% من هلام باستخدام الينوكليوتيدات 261 و 703 لتميز آليات مجاميع الدم A,B,O بواسطة إنزيمات التقييد.

استخدمت نوعين من إنزيمات التقييد الأول Kpnl الذي يحدد الطفرة الوارثية (الحذف) الموجود عند النيوكليوتيد 261 بينما الإنزيم الثاني AluI فيحدد الطفرة الوراثية (الاستبدال) الموجودة في النيوكليوتيد703، تم ترحيل ناتج عملية الهضم بإنزيمات التقييد على 6 % من هلام الاكاروز واطئ الانصهار لمشاهدة جميع القطع الناتجة من عملية الهضم و مقارنتها مع الحامض النووي القياسي السلمي.

أظهرت طريقة التحري الجزيئي RFLP-PCR للتحري عن صنف الدم ABO أن من مجموع 14 نموذج صنف دمهم A كان 13 منهم ذوي طرز وراثية هجينة AO و واحد فقط ذو طرز وراثي متجانس AA، بينما كان 14 نموذج صنفهم B، 13 منهم ذوي طرز وراثية هجينة BO و واحد فقط ذو طرز وراثي متجانس BB.

نموذج واحد فط لكل من صنف الدم A B O حيث كانوا متجانسي الطرز الوراثية، يعتبر صنف A B ذات سيادة مشاركة لأن كلا الإليلين يشفرون لصفاتهم على سطح كرية الدم الحمراء، أما بالنسبة للصنف O فهو ذات آليات متتحية لا تظهر إلا في حالة Homozygous وهي متنحية أمام الآليات A، B.

خلصت الدراسة أن طريقة RFLP-PCR هي سريعة، عملية، قليلة التكلفة و سنهة في قراءة النتائج.

ممكن أن تستغل في الطب العدلي الجنائي، في فحص البنوة و بعض حالات نقل الدم الدوري في مصرف الدم.

الملخص EN

Extracted of DNA from blood samples, and amplification two separate segments of the glycosyl transferases gene containing nucleotide 261 in exon 6 and nucleotide 703 in exon 7 of ABO gene locus were amplified.

ABO locus gene was amplified by using two sets of specific primers for ABO locus as a whole.

The first set includes the primer pair (1 and 2) that was used for the amplification of 200 bp DNA fragment, which contains the nucleotide 261.

The second set includes the primer pair (3 and 4) that was used to amplify a 128 bp DNA fragment, which contains the nucleotide703.

Nucleotides 261 and 703 were used to distinguish A, B, O alleles by restriction enzyme digestion of the PCR products.

The amplified DNA products were then run on 2 % agarose gel.

Two types of restriction enzyme were used.

The first was KpnI which determined the deletion at nucleotide 261(G→ -) of O allele, while the second one was Alui which determined the substitution in nucleotide 703 (G → A) that detect B allele which can be recognized from allele (Alui digest the DNA of individual with type B allele).

Digested DNA fragments were run on 6 % low melting agarose.

The thirty samples show 14 (A) blood groups, 13 of them are Heterozygous AO and one is Homozygous AA.

The 14 samples are blood group B, 13 of them are Heterozygous BO and one of them is Homozygous BB.

One sample for AB, O blood groups this type have only Homozygous phase and each gene are dominant in AB type so called co-dominant.

In O type the gene is recessive and expressed only in homozygous type only whereas the A and B genes are dominant over O.

نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)

Muhammad, Ahmad Kazim& Umar, Amirah Jabir& al-Tai, Muhammad Ibrahim Nadir Mahmud. 2010. Study of optimum conditions in detection of ABO genotype by simultaneous PCR-RFLP method. Iraqi Journal of Science،Vol. 51, no. 4, pp.588-597.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-309100

نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)

Muhammad, Ahmad Kazim…[et al.]. Study of optimum conditions in detection of ABO genotype by simultaneous PCR-RFLP method. Iraqi Journal of Science Vol. 51, no. 4 (2010), pp.588-597.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-309100

نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)

Muhammad, Ahmad Kazim& Umar, Amirah Jabir& al-Tai, Muhammad Ibrahim Nadir Mahmud. Study of optimum conditions in detection of ABO genotype by simultaneous PCR-RFLP method. Iraqi Journal of Science. 2010. Vol. 51, no. 4, pp.588-597.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-309100

نوع البيانات

مقالات

لغة النص

الإنجليزية

الملاحظات

Includes bibliographical references : p. 596-597

رقم السجل

BIM-309100