Detection and identification of erwinia carotovora subsp. atroseptica (van hall, 1902) the causal agent of potato blackleg by RFLP-PCR
العناوين الأخرى
الكشف عن تعريف مرض الساق السوداء على البطاطا (Erwinia carotovora subsp. atroseptica (Van Hall, 1902)) باستخدام الـ RFLP-PCR
المؤلفون المشاركون
Akash, Muhannad
Khulayf, Hamid M.
al-Zumur, Riyad
المصدر
Jordan Journal of Agricultural Sciences
العدد
المجلد 9، العدد 2 (30 يونيو/حزيران 2013)، ص ص. 170-183، 14ص.
الناشر
الجامعة الأردنية عمادة البحث العلمي
تاريخ النشر
2013-06-30
دولة النشر
الأردن
عدد الصفحات
14
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص AR
في هذه الدراسة، تم تسجيل انتشار مرض الساق السوداء في البطاطا و دراسته في مناطق زراعة البطاطا المختلفة في الأردن : وادي الأردن (الكرامة، الشونة الجنوبية، مثلث المصري، المعدي، ديرعلا، ضرار، كريمة)، عمان (اليادوة)، مأدبا (أم العمد)، جرش (طواحين العدوان)، معان (رم، المدورة)، حيث تم عزل و تعريف 46 عزلة من البكتريا ECA، و هي المسبب المرضي لمرض الساق السوداء في البطاطا من المناطق المختلفة.
استخدم تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) في تضخيم حزمة ال، DNA ذات الحجم (690-bp) لتأكيد وجود بكتريا Eca بعد عزلها و تمت مقارنة هذه الطريقة مع طريقة الكشف عن البكتيريا بالعزل المباشر على بيئة لوغان الغذائية (Logans medium) من سيقان و درنات البطاطا التي تظهر عليها الأعراض، و أخرى لا تظهر عليها الأعراض، حيث أشارت النتائج إلى أن عزل المسبب المرضي تم في 30 % من عينات البطاطا المصابة، بينما تم الكشف عن 690-bp band في 88 % من مستخلصات ال DNA للعينات نفسها باستخدام ال PCR.
كما تم إجراء الكشف عن وجود المسبب المرضي في عينات نباتات البطاطا لا تظهر عليها أعراض المرض و لم يعزل المسبب المرضي مباشرة على البيئة، بينما تم كشف ال 690-bp band في 8 % من العينات.
و عند إجراء الكشف عن وجود المسبب المرضي في درنات بدلا من سوق لا تظهر عليها أعراض الإصابة تم عزل Eca من 4 % من هذه العينات على بيئة لوغان، في المقابل تم الحصول على 690-bp band في 32 % من مستخلص DNA للعينات نفسها.
و عليه ؛ فإن استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل هو الأكثر حساسية للكشف عن هذا المرض من أجل الكشف عن التباين الوراثي بين الـ 46، عزلة من الـ Eca استخدمت طريقة RFLP-PCR، حيث تم هضم الحزمة الـ DNA ذات الحجم (690-bp) بوساطة استخدام الأنزيمات AluI, HaeIII, HpaII and SauAI و قسمت العزلات إلى خمس مجموعات، وقد أظهرت النتائج أن هذه المجموعات ذات تباين وراثي قليل.
الملخص EN
Potato blackleg disease is surveyed for spreading out in different potato growing areas in Jordan including Jordan Valley (Al-Karama, Ashshuna Al-Janubiyya, Muthallath Al-Misri, Mu’addi, Deir Alla, Dirar, and Kurayyima), Amman (Al-Yadoda), Madaba (Om Al-Amad), Jerash (Tawahin Al-Udwan), Ma’an (Rum, and Al-Mudawwara).
Forty six bacterial isolates of Erwinia carotovora subsp.
atroseptica (Eca), the causal agent of the disease, were isolated and identified by different biochemical, physiological and nutritional tests from 145 diseased potato samples collected.
Polymerase chain reaction (PCR)-based amplification of a 690-bp band was used to confirm the presence of Eca in the isolated bacteria estimated by the reference culture (ATCC 15713).
PCR amplification was followed in isolation, identification and detection of Eca in infected and symptomless potato-stem and -tuber samples.
The results showed that Eca was isolated from 30 % of naturally infected potato samples with blackleg, while the 690-bp band was detected in 88 % of DNA extracts from the naturally infected potato samples.
In the other hand Eca was not isolated from the symptomless potato stem samples, while the 690-bp band was detected in 8 % of the DNA extract from these stem samples.
However; using symptomlesstuber samples have improved isolation efficiency.
Eca was isolated directly from 4 % of the samples when their suspension was streaked on Logan’s medium plates however 690-bp band was detected from 32 % of their DNAextract amplified with PCR.
Genetic variability among the Eca isolates has been able to detect 690-bp PCR products for 46 different isolates those were digested with the restriction enzymes i.e.
AluI, HaeII, HpaII and SauAI.
Polymerase chain reaction-Restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analyses were able to cluster the Eca isolates into five PCR-RFLP groups with low genetic variability.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
al-Zumur, Riyad& Khulayf, Hamid M.& Akash, Muhannad. 2013. Detection and identification of erwinia carotovora subsp. atroseptica (van hall, 1902) the causal agent of potato blackleg by RFLP-PCR. Jordan Journal of Agricultural Sciences،Vol. 9, no. 2, pp.170-183.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-326398
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
al-Zumur, Riyad…[et al.]. Detection and identification of erwinia carotovora subsp. atroseptica (van hall, 1902) the causal agent of potato blackleg by RFLP-PCR. Jordan Journal of Agricultural Sciences Vol. 9, no. 2 (2013), pp.170-183.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-326398
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
al-Zumur, Riyad& Khulayf, Hamid M.& Akash, Muhannad. Detection and identification of erwinia carotovora subsp. atroseptica (van hall, 1902) the causal agent of potato blackleg by RFLP-PCR. Jordan Journal of Agricultural Sciences. 2013. Vol. 9, no. 2, pp.170-183.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-326398
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 180-182
رقم السجل
BIM-326398
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر