Species identification and strain differentiation of dermatophyte by (GACA)4-primer based PCR
العناوين الأخرى
تشخيص أنواع الفطريات الجلدية و تمايز سلالاتها باستخدام التفاعل التسلسلي (GACA)4 لمبوليمراز المعتمد على البادئ
المؤلفون المشاركون
al-Jabburi, Muna Hammudi
al-Hashemi, Asra Jabbar
Ghali, Zafir Hasan
Kazim, Bara Jawad
المصدر
العدد
المجلد 55، العدد 3B (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1249-1254، 6ص.
الناشر
تاريخ النشر
2014-12-31
دولة النشر
العراق
عدد الصفحات
6
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص AR
تعد الفطريات الجلدية أعفان مرتبطة من الناحيتين الشكلية و الوظيفية و يسبب بعضها إصابات واضحة منها القوباء الحلقية.
تهدف هذه الدراسة إلى تشخيص أنواع و ضروب الفطريات الجلدية المعزولة من مرضى محافظة واسط في العراق باستخدام طريقة البصمة الوراثية المعتمدة على التفاعل التسلسلي للبوليمراز.
أظهر التشخيص الوراثي على المستوى الجزيئي باستخدام البصمة الوراثية أنماط للحامض النووي منقوص الأوكسجين DNA لكل نوع من الفطريات الجلدية : أستخدم البادئ القصير قليل النيوكليوتيدات (GACA)4 لإيجاد البصمة الوراثية بوصفة بادئا لتشخيص عزلات الفطريات الجلدية.
شخصت بهذه الطريقة أنواع و ضروب مختلفة بين الفطريات الجلدية و تراوح عدد حزم التفاعل التسلسلي للبوليمراز الناتجة من 1-4 حزمة لكل نوع و مدى حجم تراوح ما بين 600 زوج قاعدي إلى 1600 زوج قاعدي.
كانت نماذج الحزم الناتجة متميزة لأنواع و ضروب ال Trichophyton و Microsporum التي شخصت بهذه الطريقة.
أظهر النوعين Trichophyton soudanense و verrucosum Trichophyton طرز متميزة بأربع حزم كبيرة (800 زوج قاعدي إلى 1900 زوج قاعدي) بين أنواع ال Trichophyton.
و تمكن البادئ (GACA)4 من تضخيم جميع أنواع ال Microsporum و أدى ذلك إلى ظهور اختلافات ضمن النوع الواحد و الذي لوحظ في النوع M.
canis بين سلالته الخشنة و الملساء و التي أظهر كل منها حزم مختلفة.
نستنتج أن طريقة البصمة الوراثية باستخدام البادئ (GACA)4 طريقة سريعة لتشخيص الفطريات الجلدية كما لها الفائدة في التمايز بين أنواع و ضروب الجنسين Trichophyton , Microsporum.
الملخص EN
ermatophytes are a group of morphologically and physiologically related molds some of which cause well defined infections: dermatophytoses (tineas or ringworm).
The present study aims at identification of dermatophytes species and varieties from patients in Wasit province-Iraq using molecular approach based PCR fingerprint.
The short oligonucleotide (GACA)4 is a microsatellite primer was used in this study for identification of dermatophyte isolates.
The results identified different species and varieties among dermatophytes.
The numbers of resulting PCR bands ranged from 1 to 4 (size range, 600bp to 1600bp) for each species.
The resulting patterns were distinct for Trichophyton and Microsporum species and varieties.
Trichophyton soudanense and Trichophyton verrucosum revealed distinguishable profiles with four largest bands (800bp to 1900bp) among Trichophyton species.
(GACA)4 is able to amplify all species of Microsporum producing intraspecies variation which is observed with Microsporum canis (rough strain) and Microsporum canis (smooth strain), all of which had different band pattern.
We conclude that (GACA)4-based PCR has utility as a rapid method for identification of dermatophytes species as well as its utility for differentiation of Trichophyton and Microspmoru species and varieties.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
al-Hashemi, Asra Jabbar& al-Jabburi, Muna Hammudi& Ghali, Zafir Hasan& Kazim, Bara Jawad. 2014. Species identification and strain differentiation of dermatophyte by (GACA)4-primer based PCR. Iraqi Journal of Science،Vol. 55, no. 3B, pp.1249-1254.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394975
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
al-Hashemi, Asra Jabbar…[et al.]. Species identification and strain differentiation of dermatophyte by (GACA)4-primer based PCR. Iraqi Journal of Science Vol. 55, no. 3B (2014), pp.1249-1254.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394975
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
al-Hashemi, Asra Jabbar& al-Jabburi, Muna Hammudi& Ghali, Zafir Hasan& Kazim, Bara Jawad. Species identification and strain differentiation of dermatophyte by (GACA)4-primer based PCR. Iraqi Journal of Science. 2014. Vol. 55, no. 3B, pp.1249-1254.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-394975
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 1254
رقم السجل
BIM-394975
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر