Species identification and strain differentiation of dermatophyte by (GACA)‎4-primer based PCR

الملخص AR

تعد الفطريات الجلدية أعفان مرتبطة من الناحيتين الشكلية و الوظيفية و يسبب بعضها إصابات واضحة منها القوباء الحلقية.

تهدف هذه الدراسة إلى تشخيص أنواع و ضروب الفطريات الجلدية المعزولة من مرضى محافظة واسط في العراق باستخدام طريقة البصمة الوراثية المعتمدة على التفاعل التسلسلي للبوليمراز.

أظهر التشخيص الوراثي على المستوى الجزيئي باستخدام البصمة الوراثية أنماط للحامض النووي منقوص الأوكسجين DNA لكل نوع من الفطريات الجلدية : أستخدم البادئ القصير قليل النيوكليوتيدات (GACA)4 لإيجاد البصمة الوراثية بوصفة بادئا لتشخيص عزلات الفطريات الجلدية.

شخصت بهذه الطريقة أنواع و ضروب مختلفة بين الفطريات الجلدية و تراوح عدد حزم التفاعل التسلسلي للبوليمراز الناتجة من 1-4 حزمة لكل نوع و مدى حجم تراوح ما بين 600 زوج قاعدي إلى 1600 زوج قاعدي.

كانت نماذج الحزم الناتجة متميزة لأنواع و ضروب ال Trichophyton و Microsporum التي شخصت بهذه الطريقة.

أظهر النوعين Trichophyton soudanense و verrucosum Trichophyton طرز متميزة بأربع حزم كبيرة (800 زوج قاعدي إلى 1900 زوج قاعدي) بين أنواع ال Trichophyton.

و تمكن البادئ (GACA)4 من تضخيم جميع أنواع ال Microsporum و أدى ذلك إلى ظهور اختلافات ضمن النوع الواحد و الذي لوحظ في النوع M.

canis بين سلالته الخشنة و الملساء و التي أظهر كل منها حزم مختلفة.

نستنتج أن طريقة البصمة الوراثية باستخدام البادئ (GACA)4 طريقة سريعة لتشخيص الفطريات الجلدية كما لها الفائدة في التمايز بين أنواع و ضروب الجنسين Trichophyton , Microsporum.