Evaluation of DNA extraction from archieved formalin-fixed paraffin tissues (FFPT) by B-globin gene PCR
العناوين الأخرى
تقييم الدنا المستخلص من قوالب الأنسجة الشمعية مخزونة باستخدام تفاعل أنزيم البلمرة لجين بيتا كلوبين
المؤلفون المشاركون
al-Janabi, Hashim Rahim Tarish
al-Janabi, Asad
Nizar, Ahmad Muhammad Ali
المصدر
Kufa Journal for Nursing Sciences
العدد
المجلد 4، العدد 3 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
تاريخ النشر
2014-12-31
دولة النشر
العراق
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص AR
خلفية البحث : إن معرفة الحالة التي يكون عليها الحامض النووي قبل الشروع في الكشف الجزيئي له أهمية كبيرة في إجراء الحسابات الرياضية و التي من خلالها يتم معرفة كمية و نوعية الحامض النووي المستخدم.
الهدف : إن الطرق التقليدية لاستخلاص الدنا فيها من المحددات ما يمنع معرفة كفاءة و نوعية الدنا و خصوصا من العينات الحاوية على خلايا قليلة لهذا فإن نوعية و كفاءة الدنا يمكن تحديدها من خلال فحص البيتا كلوبين و جهاز النانودروب على التوالي سيما أن استخلاص الدنا من الأنسجة المثبتة بالفورمالين ضروريا للأبحاث الجزيئية و خصوصا مع تقدم العلوم التقنية الجزيئية.
المنهجية : الدراسة الحالية اختبرت نماذج الأنسجة المثبتة بالفورمالين لسرطان الثدي لنساء عراقيات، و التي جمعت من مستشفى الصدر التعليمي في وحدة النسيج المرضي و وحدة الأورام، وحدة مختبرات خاصة في محافظة النجف، النماذج كانت مخزونة للسنوات (2008, 2009, 2010 و 2011).
النماذج تضمنت، 54 نموذج لسرطان الثدي، 21 نموذج التليف ألغدي، 18 نموذج لألتهاب ثدي، 19 نموذج لحالات توسع القنوات الثديية.
النتائج : كان متوسط كمية 61.68 ng / ul) DNA) بينما نوعية DNA التي ظهرت إيجابية في تفاعل أنزيم البلمرة للبيتا كلويين كانت 71.42 % (80 من 112)، فكانت نماذج سرطان الثدي 70.37 % (38 من 54)، و نماذج التليف ألغدي 85.71 % (18 من 21)، و نماذج التهاب الثدي 77.77 % (14من 18) و نموذج التهاب خلية البلاستولهة الخارجة 52.63 % (10 من 19)، حيث كان هناك اختلاف معنوي (P < 0.5).
كما أظهر تفاعل إنزيم البلمرة لجين البيتا كلوبين نتائج مختلفة من الحزم تبعا لحالة الدنا المستخلص.
الاستنتاجات : يعتبر تقييم الدنا المستخلص بالنانودروب و البيتا كلوبين من أسهل و أدق الطرق بالمقارنة مع نتائج باحثين آخرين عملوا على طرق تقييم أخرى.
التوصيات : توصي الدراسة باعتماد تقييم البيتا كلوبين تجنبا لحصول نتائج سلبية كاذبة بسبب تكسر الدنا.
الملخص EN
Background : the knowledge of the nucleic acid state before start to molecular detection have a great importance to make a math measurements by which the nucleic acid quantity and quality will be knows.
Objective : Conventional methods have limitations for extracting amplifiable DNA from specimens containing a small number of cells.
DNA quality and quantity was evaluated by β-globin amplification and NanoDrop instrument respectively.
DNA extraction from FFPT has become essential for molecular research specially with advances in molecular technology.
Methods : The current study tested breast cancer FFPT specimens of Iraqi women which collected from AL-Sader teaching hospital histopathology and neoplasm units, and several privet histopathology labs in AL-Najaf province, the specimens were stored for the years (2008, 2009, 2010 and 2011).
The specimens were included of BC 54, fibroadenoma 21, mastitis 18, and ductectesia 19 samples.
Results : Specific primers were used to detect the activity of beta-globin gene by PCR technique and the results appeared that The mean of DNA quantity was (61.68 ng / ul) while the DNA extract quality which appeared positive by β-glubine PCR was 71.42 % (80 of 112), BC 70.37 % (38 of 54), fibroadenoma 85.71 % (18 of 21), mastitis 77.77 % (14 of 18) and ductectesia 52.63 % (10 of 19), there was a significant difference (p < 0.5).
The beta-globin PCR appeared different results depending on the DNA stats.
Conclusions : the evaluation of the extracted DNA by NanoDrop system and beta-globin gene is the easiest and definite method compared with other researchers who worked of other evaluation methods.
Recommendations : This study recommends that every study performed on DNA should be started with beta-globin testing to avoid false negative results caused by degraded DNA.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
al-Janabi, Hashim Rahim Tarish& al-Janabi, Asad& Nizar, Ahmad Muhammad Ali. 2014. Evaluation of DNA extraction from archieved formalin-fixed paraffin tissues (FFPT) by B-globin gene PCR. Kufa Journal for Nursing Sciences،Vol. 4, no. 3, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-434390
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
al-Janabi, Hashim Rahim Tarish…[et al.]. Evaluation of DNA extraction from archieved formalin-fixed paraffin tissues (FFPT) by B-globin gene PCR. Kufa Journal for Nursing Sciences Vol. 4, no. 3 (2014), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-434390
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
al-Janabi, Hashim Rahim Tarish& al-Janabi, Asad& Nizar, Ahmad Muhammad Ali. Evaluation of DNA extraction from archieved formalin-fixed paraffin tissues (FFPT) by B-globin gene PCR. Kufa Journal for Nursing Sciences. 2014. Vol. 4, no. 3, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-434390
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references : p. 10-11
رقم السجل
BIM-434390
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر