![](/images/graphics-bg.png)
Predicting Protein Interactions by Brownian Dynamics Simulations
المؤلفون المشاركون
Zhang, Hong-Xing
Meng, Xuan-Yu
Cui, Meng
Mezei, Mihaly
Xu, Yu
المصدر
Journal of Biomedicine and Biotechnology
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-11، 11ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-02-15
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
11
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
We present a newly adapted Brownian-Dynamics (BD)-based protein docking method for predicting native protein complexes.
The approach includes global BD conformational sampling, compact complex selection, and local energy minimization.
In order to reduce the computational costs for energy evaluations, a shell-based grid force field was developed to represent the receptor protein and solvation effects.
The performance of this BD protein docking approach has been evaluated on a test set of 24 crystal protein complexes.
Reproduction of experimental structures in the test set indicates the adequate conformational sampling and accurate scoring of this BD protein docking approach.
Furthermore, we have developed an approach to account for the flexibility of proteins, which has been successfully applied to reproduce the experimental complex structure from the structure of two unbounded proteins.
These results indicate that this adapted BD protein docking approach can be useful for the prediction of protein-protein interactions.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Meng, Xuan-Yu& Xu, Yu& Zhang, Hong-Xing& Mezei, Mihaly& Cui, Meng. 2012. Predicting Protein Interactions by Brownian Dynamics Simulations. Journal of Biomedicine and Biotechnology،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447294
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Meng, Xuan-Yu…[et al.]. Predicting Protein Interactions by Brownian Dynamics Simulations. Journal of Biomedicine and Biotechnology No. 2012 (2012), pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447294
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Meng, Xuan-Yu& Xu, Yu& Zhang, Hong-Xing& Mezei, Mihaly& Cui, Meng. Predicting Protein Interactions by Brownian Dynamics Simulations. Journal of Biomedicine and Biotechnology. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-11.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447294
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-447294
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)