A Colorimetric Method for Monitoring Tryptic Digestion Prior to Shotgun Proteomics
المؤلفون المشاركون
Somiari, Stella B.
Renganathan, Kutralanathan
Russell, Stephen
Mayko, Florentina
Wolfe, Steven
Somiari, Richard I.
المصدر
International Journal of Proteomics
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-02-10
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الموضوعات
الملخص EN
Tryptic digestion is an important preanalytical step in shotgun proteomics because inadequate or excessive digestion can result in a failed or incomplete experiment.
Unfortunately, this step is not routinely monitored before mass spectrometry because methods available for protein digestion monitoring either are time/sample consuming or require expensive equipment.
To determine if a colorimetric method (ProDM Kit) can be used to identify the extent of tryptic digestion that yields the best proteomics outcome, plasma and serum digested for 8 h and 24 h were screened with ProDM, Bioanalyzer, and LC/MS/MS, and the effect of digestion on the number of proteins identified and sequence coverage was compared.
About 6% and 16% less proteins were identified when >50% of proteins were digested in plasma and serum, respectively, compared to when ~46% of proteins were digested.
Average sequence coverage for albumin, haptoglobin, and serotransferrin after 2 h, 8 h, and 24 h digestion was 52%, 45%, and 45% for serum and 54%, 47%, and 42% for plasma, respectively.
This paper reiterates the importance of optimizing the tryptic digestion step and demonstrates the extent to which ProDM can be used to monitor and standardize protein digestion to achieve better proteomics outcomes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Somiari, Richard I.& Renganathan, Kutralanathan& Russell, Stephen& Wolfe, Steven& Mayko, Florentina& Somiari, Stella B.. 2014. A Colorimetric Method for Monitoring Tryptic Digestion Prior to Shotgun Proteomics. International Journal of Proteomics،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447618
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Somiari, Richard I.…[et al.]. A Colorimetric Method for Monitoring Tryptic Digestion Prior to Shotgun Proteomics. International Journal of Proteomics No. 2014 (2014), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447618
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Somiari, Richard I.& Renganathan, Kutralanathan& Russell, Stephen& Wolfe, Steven& Mayko, Florentina& Somiari, Stella B.. A Colorimetric Method for Monitoring Tryptic Digestion Prior to Shotgun Proteomics. International Journal of Proteomics. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447618
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-447618
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر