High Levels of Sequence Diversity in the 5′ UTRs of Human-Specific L1 Elements
المؤلفون المشاركون
Han, Kyudong
Lee, Jungnam
Mun, Seyoung
Meyer, Thomas J.
المصدر
Comparative and Functional Genomics
العدد
المجلد 2012، العدد 2012 (31 ديسمبر/كانون الأول 2012)، ص ص. 1-8، 8ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-02-07
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
8
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Approximately 80 long interspersed element (LINE-1 or L1) copies are able to retrotranspose actively in the human genome, and these are termed retrotransposition-competent L1s.
The 5′ untranslated region (UTR) of the human-specific L1 contains an internal promoter and several transcription factor binding sites.
To better understand the effect of the L1 5′ UTR on the evolution of human-specific L1s, we examined this population of elements, focusing on the sequence diversity and accumulated substitutions within their 5′ UTRs.
Using network analysis, we estimated the age of each L1 component (the 5′ UTR, ORF1, ORF2, and 3′ UTR).
Through the comparison of the L1 components based on their estimated ages, we found that the 5′ UTR of human-specific L1s accumulates mutations at a faster rate than the other components.
To further investigate the L1 5′ UTR, we examined the substitution frequency per nucleotide position among them.
The results showed that the L1 5′ UTRs shared relatively conserved transcription factor binding sites, despite their high sequence diversity.
Thus, we suggest that the high level of sequence diversity in the 5′ UTRs could be one of the factors controlling the number of retrotransposition-competent L1s in the human genome during the evolutionary battle between L1s and their host genomes.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Lee, Jungnam& Mun, Seyoung& Meyer, Thomas J.& Han, Kyudong. 2012. High Levels of Sequence Diversity in the 5′ UTRs of Human-Specific L1 Elements. Comparative and Functional Genomics،Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447991
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Lee, Jungnam…[et al.]. High Levels of Sequence Diversity in the 5′ UTRs of Human-Specific L1 Elements. Comparative and Functional Genomics No. 2012 (2012), pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447991
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Lee, Jungnam& Mun, Seyoung& Meyer, Thomas J.& Han, Kyudong. High Levels of Sequence Diversity in the 5′ UTRs of Human-Specific L1 Elements. Comparative and Functional Genomics. 2012. Vol. 2012, no. 2012, pp.1-8.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-447991
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-447991
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر