![](/images/graphics-bg.png)
An Exploration of the Triplet Periodicity in Nucleotide Sequences with a Mature Self-Adaptive Spectral Rotation Approach
المؤلفون المشاركون
المصدر
Journal of Applied Mathematics
العدد
المجلد 2014، العدد 2014 (31 ديسمبر/كانون الأول 2014)، ص ص. 1-9، 9ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2014-08-12
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
9
التخصصات الرئيسية
الملخص EN
Previously, for predicting coding regions in nucleotide sequences, a self-adaptive spectral rotation (SASR) method has been developed, based on a universal statistical feature of the coding regions, named triplet periodicity (TP).
It outputs a random walk, that is, TP walk, in the complex plane for the query sequence.
Each step in the walk is corresponding to a position in the sequence and generated from a long-term statistic of the TP in the sequence.
The coding regions (TP intensive) are then visually discriminated from the noncoding ones (without TP), in the TP walk.
In this paper, the behaviors of the walks for random nucleotide sequences are further investigated qualitatively.
A slightly leftward trend (a negative noise) in such walks is observed, which is not reported in the previous SASR literatures.
An improved SASR, named the mature SASR, is proposed, in order to eliminate the noise and correct the TP walks.
Furthermore, a potential sequence pattern opposite to the TP persistent pattern, that is, the TP antipersistent pattern, is explored.
The applications of the algorithms on simulated datasets show their capabilities in detecting such a potential sequence pattern.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Chen, Bo& Ji, Ping. 2014. An Exploration of the Triplet Periodicity in Nucleotide Sequences with a Mature Self-Adaptive Spectral Rotation Approach. Journal of Applied Mathematics،Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-452098
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Chen, Bo& Ji, Ping. An Exploration of the Triplet Periodicity in Nucleotide Sequences with a Mature Self-Adaptive Spectral Rotation Approach. Journal of Applied Mathematics No. 2014 (2014), pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-452098
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Chen, Bo& Ji, Ping. An Exploration of the Triplet Periodicity in Nucleotide Sequences with a Mature Self-Adaptive Spectral Rotation Approach. Journal of Applied Mathematics. 2014. Vol. 2014, no. 2014, pp.1-9.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-452098
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-452098
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
![](/images/ebook-kashef.png)
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر
![](/images/kashef-image.png)