Features-Based Deisotoping Method for Tandem Mass Spectra
المؤلفون المشاركون
Yuan, Zheng
Lin, Wenjun
Wu, Fang-Xiang
Chen, Bolin
Shi, Jinhong
المصدر
العدد
المجلد 2011، العدد 2011 (31 ديسمبر/كانون الأول 2011)، ص ص. 1-12، 12ص.
الناشر
Hindawi Publishing Corporation
تاريخ النشر
2012-01-04
دولة النشر
مصر
عدد الصفحات
12
التخصصات الرئيسية
العلوم الطبيعية والحياتية (متداخلة التخصصات)
الأحياء
الملخص EN
For high-resolution tandem mass spectra, the determination of monoisotopic masses of fragment ions plays a key role in the subsequent peptide and protein identification.
In this paper, we present a new algorithm for deisotoping the bottom-up spectra.
Isotopic-cluster graphs are constructed to describe the relationship between all possible isotopic clusters.
Based on the relationship in isotopic-cluster graphs, each possible isotopic cluster is assessed with a score function, which is built by combining nonintensity and intensity features of fragment ions.
The non-intensity features are used to prevent fragment ions with low intensity from being removed.
Dynamic programming is adopted to find the highest score path with the most reliable isotopic clusters.
The experimental results have shown that the average Mascot scores and F-scores of identified peptides from spectra processed by our deisotoping method are greater than those by YADA and MS-Deconv software.
نمط استشهاد جمعية علماء النفس الأمريكية (APA)
Yuan, Zheng& Shi, Jinhong& Lin, Wenjun& Chen, Bolin& Wu, Fang-Xiang. 2012. Features-Based Deisotoping Method for Tandem Mass Spectra. Advances in Bioinformatics،Vol. 2011, no. 2011, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-454876
نمط استشهاد الجمعية الأمريكية للغات الحديثة (MLA)
Yuan, Zheng…[et al.]. Features-Based Deisotoping Method for Tandem Mass Spectra. Advances in Bioinformatics No. 2011 (2011), pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-454876
نمط استشهاد الجمعية الطبية الأمريكية (AMA)
Yuan, Zheng& Shi, Jinhong& Lin, Wenjun& Chen, Bolin& Wu, Fang-Xiang. Features-Based Deisotoping Method for Tandem Mass Spectra. Advances in Bioinformatics. 2012. Vol. 2011, no. 2011, pp.1-12.
https://search.emarefa.net/detail/BIM-454876
نوع البيانات
مقالات
لغة النص
الإنجليزية
الملاحظات
Includes bibliographical references
رقم السجل
BIM-454876
قاعدة معامل التأثير والاستشهادات المرجعية العربي "ارسيف Arcif"
أضخم قاعدة بيانات عربية للاستشهادات المرجعية للمجلات العلمية المحكمة الصادرة في العالم العربي
تقوم هذه الخدمة بالتحقق من التشابه أو الانتحال في الأبحاث والمقالات العلمية والأطروحات الجامعية والكتب والأبحاث باللغة العربية، وتحديد درجة التشابه أو أصالة الأعمال البحثية وحماية ملكيتها الفكرية. تعرف اكثر